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 inibitori non competitivi e incompetitivi Km Vmax
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0818_da_fakestudent86


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Inserito il - 07 gennaio 2010 : 11:07:42  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di byte Invia a byte un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Buongiorno, qualcuno saprebbe caso mai correggere la mia supposizione?
Riguardo tali inibitori e la Km (costante di michaelis menten) ela Vmax (velocità massimale):
Mediante l'azione degli inibitori non competitivi la Km non subisce variazioni perchè l'affinità fra Substrato e sito attivo dell'enzima restano invariate; Aumenta la Vmax in presenza dell'inibitore, l'inibitore una volta legato al sito attivo dell'enzima inattiva la molecola, quindi dovrebbe significare che l'enzima raggiuge prima il suo valore asintotico perché è saturata dall'inibitore, mentre sempre nello stesso grafico il complesso (E-S) ha una iperbole maggiore perché le molecole enzimatiche rimaste disponibili al decorso della reazione sono in n° inferiore.
Mediante l'azione degli inibitori incompetitivi, diminuisce sia la Vmax che la Km, questi inibitori legano solo il complesso E-S di conseguenza l'affinità non verrà intralciata per il legame del sito attivo con il substrato ma anche per la stessa ragione sopra citata ne ri-sentirà la Vmax.
spero tanto che qualcuno possa chiarirmi eventuali discrepanze, grazie a tutti e ciao.

M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2010 : 16:43:24  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Messaggio inserito da byte
Aumenta la Vmax in presenza dell'inibitore



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byte
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0818_da_fakestudent86



52 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2010 : 18:10:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di byte Invia a byte un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ciao m111, per favore, potresti illuminarmi invece di appannarmi ancora di più?
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M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 07 gennaio 2010 : 20:47:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
C'è poco da appannare, se hai problemi con le formule matematiche puoi sfruttare la memoria ricordandoti l'andamento della curva, suppongo ci siano su ogni libro i grafici delle inibizioni.
Ora sono di fretta, domani magari ne riparliamo.
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M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 08 gennaio 2010 : 11:39:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Nella inibizione non competitiva sia l'evoluzione di EI sia quella di EIS sono all'equilibrio, quindi si possono identificare le Keq, Ki e K'i ed usare per trovare rispettivamente le concentrazioni di EI ed EIS.
Nel caso puramente non comp non c'è differenza per l'inibitore a legarsi a E o a ES, infatti Ki=K'i; ciò significa che il sito di legame per l'I non è influenzato dal fatto che il sito per il S sia occupato. Questa condizione è altamente improbabile, infatti a questo punto EIS dovrebbe dar prodotti perchè se il sito per I non sente la presenza di S, allora anche il sito di S non dovrebbe sentire la presenza di I. Ciò però non accade questo, infatti c'è perdita di attività catalitica. Non sono conosciuti casi di inibizione puramente non competitiva. Se questa fosse riscontrata allora avremmo una influenza sulla Vmax ma non sulla Km; infatti v = (V/(1+[I]/Ki))/1+(Km/[S] la banale semplificazione la lascio a te, eseguendo i doppi reciproci troverai rette con pendenza = (Km/V)*(1+I/Ki) troverai la V come (1/V)*(1+I/Ki) e una Km come -1/Km

Molto diffuso è invece il tipo misto, dove variano la Vmax e la Km. Qua Ki =/ K'i, ciò significa che il complesso EI è più o meno stabile rispetto all'altro. Nel non competitivo è come se sottraessimo enzima ed infatti la Vmax nella eq è influenzata. La Km è poi influenzata sia dall'eq a valle, produttivo, EIS <-> ES + I (perdona il <-> ma non so come scriverlo qui) e da quello a monte, EI <-> E + I, la Kmapp allora dipenderà sia da Ki che da K'i, è necessario allora vedere se la Km aumenta o diminuisce.
Quando K'i>Ki l'equilibrio è spostato verso EI, se K'i<Ki allora l'eq è spostato verso EIS, se EIS è stabile allora è tirato l'eq di E+S verso ES ed è quindi la formazione del complesso ternario che tira l'efficienza specifica di quella tappa, l'eq è lo stesso, solo che è tirato in una direzione.

v = V[S]/(1+([I]/K'i))/([S]+Km((1+[I]/Ki)/(1+[I]/Ki)))
Vapp= V/(1+[I]/Ki)
Kmapp= Km((1+i/Ki)/(1+([I]/K'i))

Se K'1>Ki allora Kmapp>Km se K'i<Ki allora Kmapp<Km
Dopo ti posto i grafici.


Nella uncompetitive l'inibitore agisce solo su ES, E è libero dall'azione di disturbo, sia la Vmax che la Km sono influenzate e lo sono dallo stesso fattore 1+[I]/K'i.
La Km diminuisce e l'enzima è apparentemente più affine, ciò perchè c'è più tiraggio; è la sottrazione data dall'inibitore che porta a ESI.
Poichè V e Km sono ridotte dello stesso fattore le intercette salgono ognuna per il fattore prima detto, si ottengono rette parallele.

Ora si deve pensare che tale cinetica non è valida solo per gli inibitori, descrive anche l'azione degli attivatori, ovviamente non si troverà mai un attivatore competitivo.



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byte
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0818_da_fakestudent86



52 Messaggi

Inserito il - 08 gennaio 2010 : 14:13:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di byte Invia a byte un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie sei stata molto gentile, adesso ho capito tuto
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M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 08 gennaio 2010 : 15:19:58  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Semmai sono stato
Allora non hai bisogno dei grafici?
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nashita
Utente

klimt

Prov.: Puglia


1085 Messaggi

Inserito il - 18 aprile 2010 : 12:56:37  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di nashita Invia a nashita un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
riesumo questa discussione per chiedervi dove posso trovare la dimostrazione matematica per l'equazione di michaelis menten in presenza di un inibitore competitivo?
ovvero come si arriva alla prima formula :


V = V max [S] / (alfa*Km + [S] )

dove :

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nashita
Utente

klimt

Prov.: Puglia


1085 Messaggi

Inserito il - 18 aprile 2010 : 15:31:17  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di nashita Invia a nashita un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
il lehninger non da alcuna dimostrazione, piazza la bella formuletta lì,senza fare alcuna considerazione...

cmq sono riuscita a dimostrare quella formula e dopo vari tentativi, l'unico modo in cui sono riuscita ad ottenere qualla formula è stato quello di considerare K2 << k-1 ...se almeno il testo avesse riportato questo suggerimento, mi avrebbe risparmiato mezza giornata di tentativi....
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M111
Utente

Pleiadi

Prov.: Lucca
Città: Guamo


838 Messaggi

Inserito il - 18 aprile 2010 : 20:51:22  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di M111 Invia a M111 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
In realtà (come avrai visto) è abbastanza facile:

E*+S<->ES->E+P <->k+1;k-1 ->k+3
E*+I<-->EI <->k+2;k-2

v0=k+3[ES]
Ki=K-2/k+2=[E][I]/[EI] -> [EI]=[E][I]/Ki

allo s.s.

k+1[E][S] = (k-1+k+3)[ES] -> [E]=(k-1+k+3)[ES]/k+1[S]
[Et]=[E]+[ES]+[EI]= [E]+[ES]+([E][I]/Ki) = [ES]+[E](1+[I]/Ki)
[Et]=[ES]+((k-1+k+3)/k+1)[ES]/[S](1+[I]/Ki)
[Et]=[ES][1+((k-1+k+3)/k+1)1/S(1+[I]/Ki) ->

->[ES]=[Et]/[1+((k-1+k+3)/k+1)1/S(1+[I]/Ki)

v0=k+3[Et]/[1+((k-1+k+3)/k+1)1/S(1+[I]/Ki)

v0=Vmax/[1+(Km/[S])(1+[I]/Ki)]

So che qua si legge male, però non avevo voglia di compilare per mettertela in pdf :)
Anche se hai risolto questa potrebbe servire per altri....bhò...
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nashita
Utente

klimt

Prov.: Puglia


1085 Messaggi

Inserito il - 26 aprile 2010 : 00:00:59  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di nashita Invia a nashita un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
M111 sisi avevo risolto ...però grazie ugualmente! anzi la tua è anche più "pulita" ;)
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