Sto mettendo appunto una real time relativa per studiare l'espressione di proteine virali in cellule infette. Uso SYBR GREEN. Ora mi sono disegnato i primer con un programma, mi hanno consigliato di testarli visto che sono nuovi.
Ora per vedere se il mio sistema è efficiente: La prima volta è più opportuno usare diverse concentrazioni dei primer tipo 100uM, 50uM e 25uM oppure mantenere la loro concentrazione costante e magari diluire il campione???
Beh per testare i primers io proverei diverse concentrazioni di primers, magari con due o tre diluizioni di un campione (sempre lo stesso). Però che concentrazioni hai scritto??? Intendevi nM (nano molare)? Perchè 100uM è tantissimo! E' la soluzione madre che fai quando scogli i primers! In genere la concentrazione di primers che si usa in una PCR è 100-500nM (= 0.1-0.5uM)