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pepy86
Nuovo Arrivato



16 Messaggi

Inserito il - 11 novembre 2008 : 19:29:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di pepy86 Invia a pepy86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve a tutti....nel corso di genomica strutturale e funzionale, mi è stata spiegata la pcr real time e la relativa quantificazione dell'espressione genica in modo sia relativo che assoluto.
per quanto riguarda quest'ultima cosa, ho capito il meccanismo e anche il procedimento matematico che c'è dietro ma non riesco a dare una definziione di valore soglia e di ct...qualcuno mi può aiutare?grazie...ho provato da sola ma non sono soddisfatta..(esame giovedì)

marok
Utente Junior



150 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 08:58:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di marok Invia a marok un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Il valore soglia è un valore arbitrario al quale decidi di analizzare la reazione.
Il ct e il ciclo al quale la fluorescenza raggiunge il valore soglia.
Se ti può essere utile a pag 4 trovi praticamente la definizione:
http://www.genedia.it/italiano/quaderno/Opuscoli%20da%20pubb/RealTimeOPFO_tec1.pdf
Ma come hai fatto a capire il meccanismo della real se non hai capito queste cose basilari?
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 10:50:48  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
Il valore soglia è un valore arbitrario al quale decidi di analizzare la reazione.


Aggiungerei: corrispondente all'inizio della fase esponenziale di amplificazione

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marok
Utente Junior



150 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 13:24:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di marok Invia a marok un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se è all'inizio o alla fine non cambia nulla basta che sia fase esponenziale e comunque anche in base a come escono le curve non sempre la fase esponenziale è la migliore. Certo in un esame se te lo chiedono "fase esponenziale" è l'unica risposta giusta, ma poi in campo non sempre è così.
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 18:15:07  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
non sempre la fase esponenziale è la migliore


Se prendi il Ct fuori dalla fase esponenziale non puoi fare alcuna considerazione quantitativa

Comunque sia, per un esame "l'inizio della fase esponenziale" è una definizione appropriata.

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pepy86
Nuovo Arrivato



16 Messaggi

Inserito il - 12 novembre 2008 : 19:55:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di pepy86 Invia a pepy86 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
@ marok: se leggi bene infatti ho scritto che so cosa sono ma non sono soddisfatta della definizione che mi ha dato il prof che mi sembra poco completa...
difatti non ho scritto che NON HO CAPITO cosa sono
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