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Autore

Discussione

annamunizzo
Nuovo Arrivato

43 Messaggi

Inserito il - 22 novembre 2008 : 15:50:41

salve vorrei capire un p� meglio matrice blosum62.
� uno strumento che consente di valutare l'omologia tra le proteine oppure deriva da considerazioni teorike sulle caratteristiche chimico fisiche degli amminoacidi?
so che mette a confronto tratti di sequenze allineate con omologie tra i residui amminoacidi almeno del 62%.

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 22 novembre 2008 : 16:50:34

Ciao e benvenuta sul forum!

Se provi a fare una ricerca trovi decine di discussioni a riguardo.
http://www.molecularlab.it/forum/search.asp?mode=DoIt

Citazione:

deriva da considerazioni teorike sulle caratteristiche chimico fisiche degli amminoacidi?

No, come dicevi tu � stata ottenuta allineando diverse proteine conservate del database BLOCKS, ottenendo una determinata frequenza di sostituzione. Quei valori quindi sono stati ricavati empiricamente...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...