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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 26 febbraio 2004 : 18:53:32
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Sto appena imparando ad utilizzare il programma Rasmol.
Per la precisione sto vedendo il meccanismo di formazione del complesso di inizio della pol II.
Come sapete, la proteina TBP, che riconosce la TATA box, si lega nel solco minore del DNA.
Però osservando il modello grafico con Raswin, non è molto semplice distinguere il solco minore da quello minore, anche perchè la proteina distorce la struttura del DNA deformandolo.
Allora ho controllato sul libro e ho notato che per facilitare la visualizzazione, in genere il DNA viene marcato con due colori diversi, uno per ogni elica: ed effettivamente così è molto più semplice distinguere i due solchi.
-La mia domanda è, però: come si fa? riesco a selezionare il dna e a cambiarne il colore, ma non le singole eliche! Nemmeno utilizzando le colorazioni per 'gruppo' e simili.
Grazie!
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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atreliu
Amministratore
Prov.: Milano
Città: Milano
2484 Messaggi |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
 Inserito il - 08 marzo 2004 : 11:56:45
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| Grazie! In realtà è poco che ho a disposizione un computer, quindi sto appena iniziando a vedere come funzionano questi programmi. Credo che mi serviranno proprio, i programmi che mi avete consigliato! |
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ndina
Nuovo Arrivato
2 Messaggi |
Inserito il - 29 settembre 2005 : 20:07:35
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http://www.bernstein-plus-sons.com/software/rasmol/
ciao! il link sopra risulta danneggiato... 
Sai dove posso trovare un'altra guida in italiano di rasmol o un elenco dei comandi più usati con le relative spiegazioni?
grazie mille!
Ciao |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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ndina
Nuovo Arrivato
2 Messaggi |
Inserito il - 30 settembre 2005 : 10:14:16
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...hmmm non capisco,clicco sul file,vado per aprirlo ma mi dice " [...] il file non appartiene alla guida di internet o è danneggiato" .
E non me lo fa aprire...
Che devo fare?
Grazie |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 30 settembre 2005 : 11:12:27
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Ok, clicca col tasto dx sul link nel mio messaggio precedente e scegli "Salva oggetto con nome..." se usi Internet Explorer o "Salva destinazione come..." se usi Firefox.
Puoi salvare il file nella cartella di RasMol e volendo rinominarlo come rasmol.hlp (sostituendo il normale rasmol.hlp in eng).
nICO |
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Patrizio
Moderatore
Città: Barcellona
1915 Messaggi |
Inserito il - 30 settembre 2005 : 21:54:24
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chick80 io ho provato a scaricare DS viewer pero' non ci sto riuscendo,potresti dirmi dettagliatamente cosa dovrei fare?
grazie |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 01 ottobre 2005 : 05:22:57
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Un tempo esisteva una versione free chiamata DS Viewer. Ora pero' vedo che c'e' solo la versione Pro, che e' a pagamento...
Sul sito http://www.accelrys.com/products/dstudio/viewerpro/ puoi comunque scaricare la trial da 30gg (c'e' un link sulla dx, ti registri e ti mandano un link). Ti manderei volentieri la vecchia versione ma purtroppo e' in qualche cd di backup che ho lasciato a Milano e quindi non ho modo di cercarla sorry...
nICO |
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Colorare il DNA con Rasmol-RasTop
Guide tools online
).
