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farmacologia
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100 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 13:15:04

salve a tutti.
un collega mi ha inviato le seguenti sequenze di primer
FOR5 ggtactggtggagtatttgatagtg
REV5 AACACCTGCTTATACTAGGTTG
ed inoltre il seguente:
"N.B.:La seq del rev � da ordinare tal quale senza bisogno di fare inv e compl"
sapreste dirmi cosa intende per inv e compl?
grazie

Gabriele
Utente

Prov.: Pisa
Citt�: Pisa

615 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 13:35:18

inversione e complementare

"Chi rinuncia alla libert� per la sicurezza, non merita n� la libert� n� la sicurezza. E finir� col perdere entrambe."

Neuroscience
Utente

659 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:00:46

letteralmente senza fare il complementare, e senza invertirla

dato che nelle pcr c'� sempre un primer Forward che � la copia della sequenza di riferimento ed un Reverse che � complementare ed invertita rispetto alla sequenza... c'� sempre un po' di dubbio sul fatto che le sequenze dei primers che vengono trasmesse a qualcun altro siano la sequenza originale che amplificher� oppure sono state invertite.

Le sequenze vanno ordinate andando dall'estremit� 5' all'estremit� 3'

quindi quello che ti ha detto il tuo amico � che entrambe le sequenze sono in direzione 5' -> 3' gi� pronte da ordinare

Invertire � ABCD -> DCBA
Complementare � AAAAA -> TTTTT

Reverse � inverito e complementare, ovvero la sequenza dell'altro filamento del DNA in direzione 5' 3'

farmacologia
Nuovo Arrivato

100 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:00:48

grazie, ma continuo a non capire.
nella scelta dei primer, perch� dovrei sceglierli facendo riferimento a termini come "inversione" o "complementare"?
forse per complementare posso arivarci se mi riferisco a "complementare della sequenza target sul frammento d'interesse" ma per inversione non trovo alcuna spiegazione.
ammetto l'ignoranza.

Neuroscience
Utente

659 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:02:26

ops, ho fatto un errore.... "letteralmente significa... complementare e invertirta"

farmacologia
Nuovo Arrivato

100 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:03:33

grazie neuroscienze. mi hai anticipato nella seconda domanda

marok
Utente Junior

150 Messaggi

Inserito il - 05 febbraio 2009 : 14:03:45

Ma penso che te l'abbia detto per fugare ogni dubbio. Comunque meglio di quanto abbia fatto Neuroscience non si pu� spiegare.

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