Forum

Nome Utente:
Password:
Riconoscimi automaticamente
 Tutti i Forum
 MolecularLab
 Biochimica
 aiuto a ph2 e ph9 con henderson-hasselback
 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
I seguenti utenti stanno leggendo questo Forum Qui c'è:

Aggiungi Tag Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore Discussione  

kondalord
Nuovo Arrivato


Prov.: Bari
Città: altamura


68 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2009 : 11:36:11  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kondalord  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kondalord Invia a kondalord un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
quando utilizzo questa formula:
pH=pK+log[A-]/[HA] e ottengo un certo valore , ad esempio 10000, so che indica che [A-] è 10000 volte più grande di [HA] quindi la forma prevalente sarà quella di [A-], ma i conti non mi tornano, mi spiego meglio:

se uso l'equazione per il ph6 devo fare due calcoli
il 1° con il pka1 ed esce 10000=[COO-]/[COOH] cioè che la spece dominante è COO- ed è giusto
il 2° con il pka2 ed esce che 1/10000=[NH2]/[NH3+] cioè che la specie dominante è NH3+ ed è giusto
Quindi l'AA è sotto forma di zwitterione, e fin ui ci sono, ma se devo usarla per il ph2 o ph9, non mi trovo più, potete aiutarmi?

alanina pka1=2 pka2=9 (più o meno)
se ho che ph(=2)=pk(gli metto il pka1 cioè 2)+log [A-](ovvero COO-)/[AH] (ovvero COOH)
ottengo che 1=[COO-]/[COOH] cioè che l'alanina è nella forma dissociata dove le cariche sono bilanciate, ma so che non è vero perchè a ph2 l'alanina e nella forma protonata ovvero con -NH4+

idem per il ph 9
ph(=9)=pk(gli metto il pka2 cioè 9)+log [A-](ovvero NH2)/[AH] (ovvero NH3+)
ottengo che 1=[COO-]/[COOH] cioè che l'alanina è nella forma dissociata dove le cariche sono bilanciate, ma so che non è vero perchè a ph9 l'alanina e nella forma anionica ovvero con coo-

sicuramente sbaglio qualcosa...

kondalord
Nuovo Arrivato


Prov.: Bari
Città: altamura


68 Messaggi

Inserito il - 09 febbraio 2009 : 22:45:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kondalord  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kondalord Invia a kondalord un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
nessuno può aiutarmi?
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 10 febbraio 2009 : 07:02:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Forse quello che ti sfugge è che c'è sempre un equilibrio tra le varie forme dissociate/indissociate dei gruppi carbossilico ed aminico, NON importa il pH. Anche a pH 1 avrai degli NH2, saranno pochissimi ma ci sono sempre.


Citazione:
ottengo che 1=[COO-]/[COOH] cioè che l'alanina è nella forma dissociata dove le cariche sono bilanciate, ma so che non è vero perchè a ph2 l'alanina e nella forma protonata ovvero con -NH4+


E no! Se ottieni 1 vuol dire solo che COO- = COOH, ovvero che il 50% dei COOH è dissociato. Non avendo detto nulla sui gruppi amminici non sai nulla a riguardo. Non puoi prescindere dalla presenza dei gruppi amminici, che sono sempre là, quindi devi scrivere anche l'equazione di HH per gli NH3, non importa quale sia il pH.

Quindi, per gli NH3 avrai

2 = 9 + log[NH2]/[NH3+]

Quindi log[NH2]/[NH3+] = -7 ovvero [NH2]/[NH3+] = 10^-7, cioè hai 10 milioni di volte più NH3+ che NH2

Questo vuol dire che in media su 10 milioni di molecole, 1 sola avrà il gruppo aminico non protonato, mentre 5 milioni avranno il gruppo carbossilico dissociati. Quindi, in media, il 50% delle molecole sarà in forma zwitterionica, il 50% sarà carico +

Al pI (che in realtà è attorno a 6, poichè la pK2 dell'alanina è ~10) avrai

[COO-]/[COOH] = 10^(6-2) = 10^4
[NH2]/[NH3+] = 10^(6-10) = 10^-4

Quindi hai 10000 volte più COO- rispetto a COOH e 10000 volte più NH3+ che NH2

Questo vuol dire che su 10000 molecole IN MEDIA 1 avrà COOH e 1 avrà NH2, le altre avranno COO- e NH3+, quindi saranno in forma zwitterionica

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina

kondalord
Nuovo Arrivato


Prov.: Bari
Città: altamura


68 Messaggi

Inserito il - 11 febbraio 2009 : 10:09:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kondalord  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kondalord Invia a kondalord un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
a ecco! quindi, come per il ph=6 che usavo sia il pka1 che il pka2 (perchè giustamente sono in equilibrio), lo dev o fare anche a ph basico e acido...
grazie tante della risposta, ora mi è tutto molto più chiaro!
sui miei appunti era tutto confusionario...
grazie ancora
Torna all'inizio della Pagina

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 11 febbraio 2009 : 18:28:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
No problem

Sei un nuovo arrivato?
Leggi il regolamento del forum e presentati qui

My photo portfolio (now on G+!)
Torna all'inizio della Pagina
  Discussione  

Quanto è utile/interessante questa discussione:

 Nuova Discussione  Nuovo Sondaggio Nuovo Sondaggio
 Rispondi Aggiungi ai Preferiti Aggiungi ai Preferiti
Cerca nelle discussioni
Vai a:
MolecularLab.it © 2003-18 MolecularLab.it Torna all'inizio della Pagina