chick80
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Inserito il - 12 febbraio 2009 : 16:44:58
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Allora, una sequenza consenso è una sequenza (di DNA, RNA, aminoacidi o quello che vuoi tu) che "ha un senso" per un certo processo.
Ad esempio, un certo enzima può riconoscere la sequenza AGGGCTTACG sul DNA, oppure la sequenza Asp-Leu-Leu-Trp su una proteina. Le sequenze consenso generalmente possono essere degenerate, ad es. puoi trovare che un enzima lega il DNA sulla sequenza
ACNCCY[A-C]R
Dove N vuol dire "qualsiasi base", Y vuol dire pirimidina, R vuol dire purina e [A-C] vuol dire A oppure C.
Quindi tutte queste sequenze sono riconosciute da quell'enzima:
ACGCCTAA ACACCCCA ACCCCCAG
etc.
I promotori contengono sequenze consenso per diversi enzimi che servono per la trascrizione del DNA a RNA. Ad es. il TATA box ha sequenza consenso: 5'-TATAAA-3' generalmente seguita da diverse A.
Un modo di rappresentare le sequenze consenso è il seguente (questa è la sequenza di Kozak sull'mRNA, importante per l'inizio della traduzione)
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