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 significato parentesi nella sequenza primers
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Dees
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5 Messaggi

Inserito il - 18 febbraio 2009 : 13:19:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dees Invia a Dees un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve, sono 3 anni che sto in laboratorio e sono spiazzata:
ho trovato una sequenza di primer che contiene all'interno parentesi. Chi mi sa dire il significato?
Siccome devo ordinare tali primers voglio sapere esattamente cosa devo ordinare.

La sequenza in questione è

5' - TAG (AG) GAT TGG AGG TCG TCA - 3'

Grazie

valia
Moderatore


Prov.: UK


1001 Messaggi

Inserito il - 18 febbraio 2009 : 14:06:28  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di valia  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di valia Invia a valia un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Credo si tratti di un primer degenerato, in quella posizione avrai quindi A oppure G.
Quella dicitura dovrebbe essere l'equivalente di:

5' - TAG R GATTGGAGGTCGTCA - 3'

Dove R sta per puRine (A e G).

Quindi nella tua mix dei primer, meta' delle molecole avra' A, l'altra meta' invece avra' G!


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