ho bisogno di un aiuto.. volevo sapere ma nella pcr real time ( che non ho mia fatto) come si fa a scegliere il valore della linea soglia con la quale poi ci si calcola il ciclo soglia.
Allora, c'è l'impostazione automatica con la quale è la stesso programma che individua il punto migliore altrimenti con l'impostazione manuale sposti tu la linea soglia che dovrebbe essere al livello del punto di flesso delle curve che ottieni dopo la reazione.Il punto di flesso infatti corrisponde alla fase esponenziale della reazione cioè quella in cui in teoria ad ogni ciclo si duplica la quantità di DNA. E' inoltre importante che la linea soglia sia nel punto in cui tutte le curve che ottieni dalla reazione sono più vicine tra loro...purtroppo senza figure è un pò difficile spiegare, dovresti vedere le immagini di qualche reazione se ne hai la possibilità. Spero di essere stata abbastanza chiara ma se hai dubbi cerco di esserlo di più
Questa è l'immagine delle curve dove vedi il punto di flesso in cui si posiziona la soglia (linea rossa)
La cosa si vede meglio guardando le cure in funzione esponenziale:
Citazione:Messaggio inserito da angemore
E' inoltre importante che la linea soglia sia nel punto in cui tutte le curve che ottieni dalla reazione sono più vicine tra loro...
Le curve devono essere tutte parallele tra loro, non "vicine". Se sono vicine vuol dire che escono ad un ciclo soglia vicino, quindi sono più o meno la stessa quantità!