database di Protein-Protein interaction?

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Al cuore della vita. Il suicidio cellulare e la morte creatrice
Jean Claude Ameisen

Biologia marina
Giuseppe Cognetti, Giuseppe Magazzù, Michel Sarà

Biologia dello sviluppo
Scott F. Gilbert

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Bioinformatica

database di Protein-Protein interaction?

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Bioinformatica:

Guide tools online

Blog InsideBioinfo

Siti di Bioinformatica

Protocolli

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto è utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

RNA world
Utente Junior

370 Messaggi

Inserito il - 31 marzo 2009 : 13:05:04

ciao a tutti,

sapete consigliarmi dei database dove sono raccolte informazioni su proteine di lievito ad esempio e le loro osservazioni osservate tramite test del doppio ibrido e/o deletoma?

grazie

domi84
Moderatore

Città: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 31 marzo 2009 : 14:37:09

Mmm...non ho capito bene cosa cerchi...
Forse IntAct può aiutarti?
http://www.ebi.ac.uk/intact/site/index.jsf

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

dallolio_gm
Moderatore

Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna

2445 Messaggi

Inserito il - 31 marzo 2009 : 14:48:15

Ti ho cambiato il titolo del topic, ti dispiace?

Questa pagina qui elenca un buon numero di risorse su Protein-Protein interaction:
- http://mips.gsf.de/proj/ppi/

A parte String, che mi é sempre sembrato ottimo, potresti dare una occhiata a iHOP, che é quel tool che intenta predirre interazioni proteiche analizzando automaticamente la letteratura scientifica.
Anche questo sembra essere simile a quello che richiedi:
- http://mips.gsf.de/proj/yeast/CYGD/interaction/

Ti interessano in particolare solo le interazioni ricavate tramite i sistemi che hai elencato (doppio ibrido, etc..) o era solo per fare un esempio?

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

byo_gio
Nuovo Arrivato

Prov.: MI
Città: Milano

66 Messaggi

Inserito il - 02 aprile 2009 : 05:24:00

qui ce ne son linkati parecchi...

http://www.imb-jena.de/jcb/ppi/

altrimenti, su nature methods di questo gennaio hanno presentato PINA http://csbi.ltdk.helsinki.fi/pina/ in omaggio alla nostra utentessa

RNA world
Utente Junior

370 Messaggi

Inserito il - 11 aprile 2009 : 16:27:43

grazie, ho risolto con il SGD...