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liciageno
Nuovo Arrivato
107 Messaggi |
 Inserito il - 04 aprile 2009 : 19:32:02
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Ciao,
Vorrei sapere quanto è lungo il genoma del virus dell'HIV e con quante paia di basi.
grazie
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 05 aprile 2009 : 17:21:40
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Tra l'altro c'è una certa variabilità nella lunghezza
delle regioni 'redundant' (R) dell'LTR all'interno
della specie, cioè tra le differenti semi-specie.
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Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)
Less Jim Morrison, more Sean Morrison!
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 18:22:05
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Citazione:
Messaggio inserito da chick80
Domanda stupida. Ma per i virus si parla di specie? Non si dovrebbero chiamare ceppi o qualcosa di simile?
No no si parla di specie! I ceppi sono una classificazione inferiore rispetto alla specie, anche se non esattamente una sottoclasse della specie.
VIROLOGIA: CLASSIFICAZIONE
... ma lascio la parola ai più esperti! 
EDIT: ecco appunto abbiamo postato assieme, la risposta di Giuliano è sicuramente più esaustiva! |
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Giuliano652
Moderatore
Prov.: Brescia
6941 Messaggi |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 18:40:38
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...mentre il termine "quasi-specie" (o semi-) si usa solamente nel
caso particolare di virus estremamente proni alla mutazione
(in pratica l'ho sentito usare solamente per HCV e HIV!).
Per alcuni virus ci sono thresholds ferree, tipo per HCV (9 kb):
> Species: divergenza di sequenza > 30%
> Genotype: divergenza di sequenza < 30%
> Subtypes: divergenza di sequenza ancora inferiore (non ricordo)
> Quasi-species (o semi-specie): divergenza di sequenza del 2-3%
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 18:41:51
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Però non si può utilizzare la "classica" definizione di specie come: "gruppo di organismi capaci di incrociarsi e produrre progenie fertile"... immagino che quindi sia una cosa decisa a livello di omologia genetica (?)
Appunto, dionysos mi ha appena risposto :) |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 18:42:35
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Tra l'altro non ho mai capito a cosa corrisponda il "ceppo" (strain)
...per ogni virus sembra avere un significato diverso!
L'unica cosa che so è che sta sicuramente sotto la specie. |
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 18:43:54
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Citazione:
Però non si può utilizzare la "classica" definizione di specie come: "gruppo di organismi capaci di incrociarsi e produrre progenie fertile"
Mah mi sa che 'sta definizione va un po' stretta a tutta la microbiologia.. |
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GFPina
Moderatore
Città: Milano
8408 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 19:04:04
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Citazione:
Messaggio inserito da chick80
Però non si può utilizzare la "classica" definizione di specie come: "gruppo di organismi capaci di incrociarsi e produrre progenie fertile"... immagino che quindi sia una cosa decisa a livello di omologia genetica (?)
Appunto, dionysos mi ha appena risposto :)
Aggiungo che in effetti esistono diverse definizioni di "specie"
Citazione:
da: Species (Wikipedia)
In biology, a species is one of the basic units of biological classification and a taxonomic rank. A species is often defined as a group of organisms capable of interbreeding and producing fertile offspring. While in many cases this definition is adequate, more precise or differing measures are often used, such as based on similarity of DNA or morphology. Presence of specific locally adapted traits may further subdivide species into subspecies.
Citazione:
da: Specie(Wikipedia)
Specie biologica
È la più diffusa, usata in zoologia, la biologica si basa sugli esperimenti che provano la discendenza fertile degli incroci. Dalla definizione di Dobzhansky e Mayr, la specie è rappresentata da quegli individui che incrociandosi tra loro generano potenzialmente una prole illimitatamente feconda. Ovviamente, come si amplierà più sotto, il termine, si basa su un modello necessariamente artificiale, e non è valido per tutti i casi di organismi in cui sia assente la riproduzione sessuale. In questi casi, tipici ad esempio in microbiologia, la definizione è più articolata, ed è reperibile su testi di tassonomia batterica.
Citazione:
Messaggio inserito da Dionysos
.... Subtypes: divergenza di sequenza ancora inferiore (non ricordo)
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Dionysos
Moderatore
Città: Heidelberg
1913 Messaggi |
Inserito il - 06 aprile 2009 : 19:56:28
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Genoma HIV
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