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Autore Discussione  

simcrist
Nuovo Arrivato


Prov.: Milano
Città: Milano


62 Messaggi
Inserito il - 17 aprile 2009 : 17:33:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di simcrist Invia a simcrist un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Volete entrare nel mondo della spettrometria di massa?

Questo sito fa sicuramente per voi:

http://www.ionsource.com/
Dr.Simone Cristoni
ISB srl
laboratori analisi chimiche
Analisi sostanze stupefacenti

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 17 aprile 2009 : 17:48:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Bello! Lo puoi anche segnalare nella "directory scientifica" del sito:
http://www.molecularlab.it/directory_scientifica/
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simcrist
Nuovo Arrivato


Prov.: Milano
Città: Milano


62 Messaggi
Inserito il - 17 aprile 2009 : 18:12:25  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di simcrist Invia a simcrist un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Grazie del consiglio.

Lo segnalo subito.

Citazione:
Messaggio inserito da simcrist

Volete entrare nel mondo della spettrometria di massa?

Questo sito fa sicuramente per voi:

http://www.ionsource.com/
Dr.Simone Cristoni
ISB srl
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Ra1D
Utente Junior

giro-Ra1D

Prov.: Bergamo
Città: Treviglio


174 Messaggi
Inserito il - 21 aprile 2009 : 21:15:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Ra1D Invia a Ra1D un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Very goood.....grazie
...e vicinissimo al mio sapere si accampa la tenebra della mia ignoranza...
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android
Nuovo Arrivato

Città: roma


41 Messaggi
Inserito il - 22 aprile 2009 : 21:41:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di android Invia a android un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Oooooooohhhhh!!! Finalmente un altro "massista" in questo forum
Ho dato un'occhiata di corsa al link e mi sembra ben fatto!!
Già ke ci sono provo a chiederti una cosa (nel caso in cui tu faccia analisi di proteomica):
per caso usi il peptide-prophet contenuto nella trans-proteomic-pipeline x validare i peptidi che identifichi da analisi MSMS??

ciao!!!
"il risultato può essere casuale, la prestazione no"
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simcrist
Nuovo Arrivato


Prov.: Milano
Città: Milano


62 Messaggi
Inserito il - 23 aprile 2009 : 08:26:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di simcrist Invia a simcrist un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono contento anche io di incontrare un altro massista!!!

Per rispondere alla tua domanda, si lo usiamo.

Per il database search usiamo il motore the gpm: http://www.thegpm.org

Per il denovo mi sono trovato bene con il pepnovo e tools correlati: http://proteomics.ucsd.edu/Software.html

Ed effettivamente mi sono trovato bene per la validazione con il programma che hai riportato ed in generale con i tool della proteome center: http://www.proteomecenter.org

Devo dire inoltre che sono ottimi anche i tool della proteome commons: https://proteomecommons.org/

Inoltre per aumentare l'efficienza di ionizzazione utilizziamo la nostra sorgente ionica Surface Activated Chemical Ionizationb (SACI) invece dell'ESI: http://www.isbiotechnology.com/saci.html

Abbiamo pubblicato diversi lavori utilizzando questa sorgente (http://www.isbiotechnology.com/applicazioni-saci.html) e devo dire che ci ha dato notevoli soddisfazioni.


Citazione:
Messaggio inserito da android

Oooooooohhhhh!!! Finalmente un altro "massista" in questo forum
Ho dato un'occhiata di corsa al link e mi sembra ben fatto!!
Già ke ci sono provo a chiederti una cosa (nel caso in cui tu faccia analisi di proteomica):
per caso usi il peptide-prophet contenuto nella trans-proteomic-pipeline x validare i peptidi che identifichi da analisi MSMS??

ciao!!!
Dr.Simone Cristoni
ISB srl
laboratori analisi chimiche
Analisi sostanze stupefacenti
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android
Nuovo Arrivato

Città: roma


41 Messaggi
Inserito il - 23 aprile 2009 : 23:55:31  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di android Invia a android un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ehm ehm...dopo una breve occhiata alle tue pubblicazioni e a quello che fate nel vostro lab diciamo che mi ri-definisco "aspirante massista"...ho appena finito la laurea specialistica in biotech e non so perchè pensavo fossi più o meno sul mio stesso piano

grazie per il tuo parere sul TPP...sarò più motivato ad ottimizzare la procedura e si anche io pensavo di partire da ricerca con x!tandem.

x la sorgente SACI ti dico cosa ne penso appena avrò tempo di leggere un vostro articolo a riguardo.
ah un'ultima curiosità: come fate ad eseguire analisi di Ion Imaging senza avere un MALDI?
spero non sia una domanda stupida
"il risultato può essere casuale, la prestazione no"
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