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thor
Nuovo Arrivato
Città: napoli
2 Messaggi |
 Inserito il - 18 marzo 2004 : 23:36:50
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sto impazzendo, tutti gli appunti che ho dicono che il dna destrorso si avvolge in senso antiorario, mentre il libro (il gene 6) dice il contrario,in senso orario
nel caso dei superavvolgimenti, sono positivi quando il dna si superavvolge nello stesso senso di avvolgimento delle due eliche, in questo caso destrorso,infatti il dna è più compatto, e negativi nel senso opposto?
gli appunti che ho preso in classe dicono l'opposto,cioe che è negativo quando l'avvolgimento è destrorso, mentre positivo quando è sinistrorso!
per favore aiutatemi, sto impazzendo!!
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atreliu
Amministratore
Prov.: Milano
Città: Milano
2484 Messaggi |
Inserito il - 19 marzo 2004 : 01:35:14
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Il DNA A e B è destrorso, in senso orario.
I valori topologici di un filmaento di DNA sono i seguenti e con questa regola:
Lk = Tw + Wr
Tw= torsione
Wr= contorcimento
Prendiamo un plasmide di una certa lunghezza e contiamo gli incroci tra i filamenti: 25 incroci = Lk
Apriamo il plasmide e svogliamo alcuni incroci, girando in senso antiorario (Lk diventa 23).
Quando riformiamo il plasmide, Lk per natura strutturale del dna torna a 25, ma si formano 2 incroci del plasmide su se stesso (come un otto con tre cerchi OOO ). Se si formeranno in senso destrorso il valore Wr sarà negativo, altrimenti positivo:
per un DNA con 260 coppie 23=25+(-2).
Per maggiori info leggi qui
[Documento .pdf]
Spero di esserti stato utile,
Riky |
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thor
Nuovo Arrivato
Città: napoli
2 Messaggi |
Inserito il - 20 marzo 2004 : 01:30:27
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sei stato gentilissimo!!
grazie mille!! |
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atreliu
Amministratore
Prov.: Milano
Città: Milano
2484 Messaggi |
Inserito il - 20 marzo 2004 : 03:34:47
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Figurati, un piacere.  |
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mitzi
Nuovo Arrivato
10 Messaggi |
Inserito il - 01 maggio 2014 : 03:16:32
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Citazione:
Messaggio inserito da atreliu
Il DNA A e B è destrorso, in senso orario.
I valori topologici di un filmaento di DNA sono i seguenti e con questa regola:
Lk = Tw + Wr
Tw= torsione
Wr= contorcimento
Prendiamo un plasmide di una certa lunghezza e contiamo gli incroci tra i filamenti: 25 incroci = Lk
Apriamo il plasmide e svogliamo alcuni incroci, girando in senso antiorario (Lk diventa 23).
Quando riformiamo il plasmide, Lk per natura strutturale del dna torna a 25, ma si formano 2 incroci del plasmide su se stesso (come un otto con tre cerchi OOO ). Se si formeranno in senso destrorso il valore Wr sarà negativo, altrimenti positivo:
per un DNA con 260 coppie 23=25+(-2).
Per maggiori info leggi qui
[Documento .pdf]
Spero di esserti stato utile,
Riky
Ciao! Riprendo questa discussione di 10 anni fa perchè l'esempio di atreliu è utile per farvi capire il mio dubbio. Allora partendo da questo cccDNA plasmidico destrorso con Lk 25 (TW 25, WR 0)..se io lo apro e aggiungo 2 giri, da quello che ho capito si possono presentare 2 situazioni:
1. il TW aumenta di 2, senza
superavvolgimenti. quindi Lk= 27
2. seconda situazione è che il TW rimane invariato e il WR diventa +2
quindi Lk=27. questo succede perchè la tensione dei 2 giri in
piu viene convertita in 2 superavvolgimenti positivi?? quindi è
come se i 2 twist in piu venissero convertiti in 2 whrite,
annullando però i 2 twist?
Tutto questo se attorciglio di 2 giri in piu il DNA. Ma se apro il plasmide e lo srotolo di 2 giri e poi lo richiudo..è qui il dubbio piu grande..non capisco com'è possibile creare una tensione che verrà scaricata in un superavvolgimento negativo. Se io rimuovo 2 giri il DNA dovrebbe essere piu lasso..non c'è tensione. Come fa a superavvolgersi?
Help!! Grazie!
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