Isoli il tuo batterio, ne fai una sospensione e la metti nei pozzetti. Ogni pozzetto contiene un particolare reagente (generalmente un enzima o il substrato di un enzima) che cambia colore in seguito alla reazione con il suo substrato o enzima corrispondente. Ogni batterio avrà un certo corredo di enzimi e proteine e quindi darà un certo pattern sulla strip, che ti permetterà di identificarlo!
Per alcuni gruppi microbici (es. lattobacilli) il test API va affiancato, se non sostituito, con altri tipi di test (molecolari ad es.) in quanto non in grado di distinguere tra le specie, spesso molto simili tra loro fenotipicamente, appartenenti a questi gruppi.