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1) Il fatto che l'His abbia un pKa della catena laterale di circa 6, fa sì che il suo pI (7,6) sia vicino al pH fisiologico, ovvero 7,3-7,4. In effetti secondo me è posto male perché il fatto che né la forma protonata né quella deprotonata prevalgano è una conseguenza del pI che però dipende dal pKaR!

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2) Il pKa cosa rappresenta? E il pI? Ragione su questo.
Ogni gruppo dissociabile ha la sua acidità e quindi il suo pKa. Ad uno stesso valore di pH alcuni gruppi possono dissociarsi, altri no. Il pI considera solo la carica totale dell'AA, i pKa invece prende in considerazione gruppo per gruppo.
Prendiamo sempre l'His: il pKa1 è 1,8; il pKa2 è 9,33 e il pKaR è 6
Se mettiamo questo AA ad un pH=7, per esempio, che succede?
Più intuitivamente, se il pH è molto basso, vuol dire che ci sono molti ioni H+ liberi nella soluzione, che cercano di legarsi all'AA, giusto? Quindi l'AA sarà protonato! Se invece il pH è alto, vuol dire che ci sono molti ioni OH- liberi, che cercano di trovare ioni H+ per formare acqua... E dove li prendono? Dall'AA, che quindi si ritrova deprotonato.

Prova a dare una risposta. Se non ci riesci te lo spiego, ma è meglio che ci arrivi da sola!

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noo a pH 7 il gruppo e' presente COO- ( perchè pK a < pH fisiologico) e NH3+ e nella catena laterale NH3+(PERCHè PkR < pH fisiologico)
era la relazine tra pH e pKa che non riusciv a capire.Cmq ora quello e' risolto

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Continuo pero' a non capire perchè


"Il gruppo R dell'istidina ha il 10% di probabilità di essere carico positivo a pH 7, ma la probabilità aumenta fino al 50% in soluzioni a pH 6. Per questo l'istidina è molto sensibile alle variazioni di pH nell'intervallo fisiologico"

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       COOH              COO-             COO-             COO-
       |      --->       |     --->       |      --->      |
  +H3N-C-H    <---  +H3N-C-H   <---  +H3N-C-H    <---  H2N-C-H
       |                 |                |                |
       R(N+)             R(N+)            R(N)             R(N)

     pH < 1,8       1,8 < pH < 6    6 < pH < 9,3       pH > 9,3

Citazione:

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Provo a rispiegarlo...
Tieni presente questo equilibrio:

       COOH              COO-             COO-             COO-
       |      --->       |     --->       |      --->      |
  +H3N-C-H    <---  +H3N-C-H   <---  +H3N-C-H    <---  H2N-C-H
       |                 |                |                |
       R(N+)             R(N+)            R(N)             R(N)

     pH < 1,8       1,8 < pH < 6    6 < pH < 9,3       pH > 9,3

Questo equilibrio è presente ad ogni valore di pH, ma è spostato verso una forma o l'altra in base ad esso (come ho scritto sotto le varie forme).
Al pI (7,6), la forma pi presente è la terza, di carica neutra e troviamo poi le altre 3 forme in concentrazioni minori ma sempre in modo che la somma delle cariche sia zero (definizione di pI).

Il pH fisiologico è molto vicino al pI, giusto? Che cosa succede in questo caso, secondo te?
Ragioniamo al contrario: prendiamo un altro AA, come la Arg che ha un pI di 10,7 e la poniamo ad un pH fisiologico...
Se questo pH varia, mettiamo, da 7,4 a 7,0... Cosa succede all'Arg? Praticamente niente... Nel senso che la stragrande maggioranza si troverà sempre nella forma Zwitterionica, ovvero con il carbossile dissociato, il gruppo alfa-amminico protonato e la catena laterale protonata (con carica totale, quindi, positiva). L'equilibrio si sposta un po', certo... Ma è trascurabile, in quanto il pI dell'Arg è molto lontano dal pH a cui ci troviamo, sia esso 7,0 o 7,4!

Nel caso dell'His invece, il pI è prossimo al pH fisiologico.
Se il pH varia da 7,4 a 7,8 ad esempio (stessa variazione che abbiamo considerato per l'Arg), cosa succede? Succede che l'equilibrio si sposta un po' verso la destra. La carica totale dell'His che prima era leggermente positiva (a pH 7,4) diventa leggermente negativa (pH 7,8)!
Questa è una variazione importante!

Sono riuscito ad essere un po' più chiaro?

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