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zerhos
Utente Junior
Prov.: Pisa
Città: Pisa
421 Messaggi |
 Inserito il - 17 novembre 2009 : 17:13:49
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allora,scusate il disturbo,ma nn riesco a procedere con chiarezza in questo esercizio,io ho una coppia di primers,devo vedere dove si appaiano,tm,se sn convergenti,possibili strutture a forcina ecc....
F-ttcatgtttctggggcattt
R-caggctaaagcattcccaat
il mio problema è questo:ho blastato contro tutto il genoma,e mi ha trovato solo 3 conting adatti,e in questi ho scoprerto con orrore che i miei primers distavano qualcosa come 2Mb 0_0
al che ho proceduto con una in silico,ottenendo invece un amplificato di tipo 245 pb,ho preso il mio amplificato e l ho quindi blastato contro il genoma
il risultato finale è che i miei primers amplificano una sequenza nn codificante,(se nn sbaglio tra il gene ABCD2 e un altro),e dovrebbe essere una STS (sequence tagged site).
qualche anima pia,mi dice se ha senso quello che ho fatto e va bene così?thx
ops,mi accorgo solo ora che già hanno postato domande simili alla mia,chiedo scusa per nn aver postato sotto discussioni già aperte in merito a quest argomento.
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Salvador.Dalì
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