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genoveffa
Nuovo Arrivato


Prov.: Avellino


25 Messaggi

Inserito il - 05 giugno 2006 : 16:58:18  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di genoveffa Invia a genoveffa un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ho dei dubbi:nella messa a punto di un protocollo di pcr bisogna conoscere almeno parzialmente la sequenza genica da amplificare?
la scelta dei primers deve essere con sequenza interamente complementare allo stampo?
la real time pcr è un metodo cinetico per misurare la qualità iniziale di acido nucleico presente in un campione?prevede sempre l'uso di sonde oligonucleotidiche fluorescenti?

grazie mille

domi84
Moderatore

Smile3D

Città: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 05 giugno 2006 : 18:02:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Allora:
nella messa a punto di un protocollo di pcr bisogna conoscere almeno parzialmente la sequenza genica da amplificare?
sì, devi almeno conoscere le seq dai quali farai i primers, o in alcuni tipi di PCR basta conoscere la seq per fare anche un solo primer.

la scelta dei primers deve essere con sequenza interamente complementare allo stampo?
Decisamente si, anche se è possibile che riescano a "sopportare" dei mismatch al 5', al 3' il primer deve essere assolutamente complementare alla seq altrimenti la pol non riconosce il ds.

la real time pcr è un metodo cinetico per misurare la qualità iniziale di acido nucleico presente in un campione?
Non la qualità, ma la quantità. Mi pare che più che la quantità vera e propria (in microgrammi x es.) funzioni meglio x fare confronti di quantità fra due campioni (x es. nel campione A il Dna è il doppio del campione B)

prevede sempre l'uso di sonde oligonucleotidiche fluorescenti?
sì! altrimenti come fai a rilevarne la sintesi?!tieni conto che esistono diversi tipi di sonde a fluorescenza, che usano diversi meccanismi.

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
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