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Bio_Noob
Nuovo Arrivato
14 Messaggi |
 Inserito il - 14 gennaio 2010 : 19:32:42
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qualcuno può spiegarmi il concetto di sintenia? perchè non credo di aver afferrato a pieno il significato
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ukitel
Nuovo Arrivato
78 Messaggi |
Inserito il - 14 gennaio 2010 : 20:37:04
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Il termine sintenia indica semplicemente la condizione dei locus genici che si trovano sullo stesso cromosoma.
Quindi 2 locus genici sono sintenici se sono stati assegnati allo stesso cromosoma, ma non necessariamente in linkage.
Chiarifico quest'ultima parte: siccome il linkage genetico viene definito come una frequenza di ricombinazione inferiore a quella attesa, capirai che 2 geni su uno stesso cromosoma (e quindi sintenici) possono apparire come non linked, poiché mediamente si verificano 3 crossing-over per cromosoma.
Il concetto può anche essere allargato al confronto tra specie diverse: in questo caso si parla di sintenia condivisa e non ci si riferisce a geni sullo stesso cromosoma, perché, ovviamente, i cromosomi sono unici per ogni specie, bensì al loro preciso ordine sul cromosoma.
La conservazione di tale ordine può sottintendere relazioni tra i geni: per esempio possono condividere la stessa regione regolatoria, sono vantaggiosi se ereditati insieme e così via.
Da questo punto di vista è facile capire che ricercare regioni di sintenia condivisa tra specie è un modo efficientissimo di trovare geni ortologhi.
Infine una curiosità... In tutti gli animali, i geni Hox, che sono essenziali per indirizzare lo sviluppo delle strutture corporee, sono ordinati sul cromosoma in un cluster secondo l'ordine di tali strutture sul corpo: da testa verso coda. |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 15 gennaio 2010 : 11:59:49
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| bella risposta! |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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