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Droyplant
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Inserito il - 15 gennaio 2010 : 19:20:51  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Droyplant Invia a Droyplant un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
salve, io avrei un problema da porvi, ho un esercizio da risolvere, mi chiede di disegnare una sequenza di un oligonucleotide da 25 nt la cui Tm sia pari a 58 °C in condizioni di NaCl=0,1 M, la formula che mi viene data è questa:
Tm = 81,5 + 16,6 * log10 (salt) + 0,41(% GC) - 675/n - p
non posso usare programmi,
potreste aiutarmi gentilmente? grazie.

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 15 gennaio 2010 : 20:26:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Hai tutti i dati, sostituisci nell'equazione, trovi %GC e scrivi un oligo con quella %GC.... dove ti blocchi?

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Droyplant
Nuovo Arrivato



3 Messaggi

Inserito il - 16 gennaio 2010 : 04:36:00  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Droyplant Invia a Droyplant un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ti ringrazio, quindi bisogna usare i valori assoluti senza tener conto del fatto che possano essere gradi o altro?
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi

Inserito il - 16 gennaio 2010 : 10:00:35  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sì esatto, quella è solo una formula empirica ad ogni modo.

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Droyplant
Nuovo Arrivato



3 Messaggi

Inserito il - 16 gennaio 2010 : 13:20:56  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Droyplant Invia a Droyplant un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
grazie.
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