no, quando inserisco il mio frammento all'interno di un vettore (ad esempio un plasmide) per poter ottenere il prodotto desiderato devo sapere l'orientamento (foward o reverse), so che bisogna sottoporre a una digestione con gli enzimi di restrizione e poi?
Ma cosa intendi esattamente? Se intendi quando devi inserire l'inserto nel vettore la strategia migliore è quella di tagliare le 2 estremità con enzimi di restrizione diversi, in modo che il frammento si possa inserire solo in un senso. Se invece lo hai inserito con un clonaggio blunt oppure con gli stessi enzimi di restrizione da entrambi i lati allora può essere che si sia inserito in entrambi i versi e per controllare in che verso è fai come ti ha detto Patrizio.