Ciao Se ho ben capito un multiallineamento si genera confrontando "a cascata" più sequenze, ottenendo alla fine colonne di aminoacidi conservati nella determinata posizione spaziale in tutte le sequenze prese in esame.
(Per quello che ne so io) Le informazioni ottenute da un allineamento multiplo sono rappresentate da una tabella in cui sono indicati quali amminoacidi possono essere sostituiti da quali altri, in che posizione e che gap possono essere presenti. Un riassunto di tutto l'allineamento insomma (ma non tanto riassunto quanto la sequenza consenso, non so se mi sono spiegato). Questa tabella è chiamata profilo.