Il CNBr viene utilizzato in tecniche di mapping peptidico.
Per generare una mappa peptidica si deve evitare l’idrolisi completa: in teoria una buona tecnica di idrolisi chimica dovrebbe produrre peptidi lunghi qualche decina di amminoacidi. I metodi chimici sono pero' usati di rado, in genere come completamento di quelli enzimatici nella generazione di frammenti peptidici.
I metodi chimici scindono il legame peptidico in corrispondenza di amminoacidi o di coppie di amminoacidi poco frequenti nelle normali sequenze peptidiche. Ne deriva che l’idrolisi chimica e' di norma un compromesso tra l’efficienza e la specificita' e deve avere le seguenti caratteristiche: - evitare l’idrolisi totale o troppo spinta - utilizzare reagenti facili da rimuovere - generare peptidi con caratteristiche note
L’unico metodo importante è quello in cui viene impiegato CNBr, che taglia selettivamente dove a livello della metionina.
Grazie per la risposta, ma ora ho altre domande: Il composto indicato con il termine IV come si chiama? è vero che esiste anche una forma aperta di questo composto?