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 Doppia banda dopo EZNA!?
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zelos1
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Occhio!
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31 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2010 : 09:59:06  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di zelos1  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di zelos1 Invia a zelos1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Hola a tutti!
Ho usato il kit EZNA per estrarre DNA da UNA SINGOLA BANDA di un gel di agarosio.
Dopo avere estratto e quantificato il DNA, abbiamo fatto nuovamente una elettroforesi di comprovazione: il risultato è stato che anzichè comparire una singola banda sul gel ne stavano due, come se il DNA fosse presente in due forme o si fosse rotto.
Il campione è di un plasmide, a cui manca un frammento di circa 1000 bp, quindi un plasmide aperto con le estremità fosforilate.
Abbiamo recuperato con EZNA anche la banda del frammento estratto del plasmide, dopo recupero fatta una successiva elettroforesi di comprovazione, e anche qui magicamente spuntano due bande, una della lunghezza esatta corrispondente al frammento, e un altra che non capiamo da dove provenga!
L'ipotesi più probabile è che il plasmide sia in una forma aperta, e in una chiusa o unita ad un altro plasmide, le bande in diverse elettroforesi di comprovazione sono identiche!
Fatemi sapere che ne pensate, grazie
Ciao

RM
Nuovo Arrivato



115 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2010 : 11:31:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di RM Invia a RM un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Se il frammento è di piccole dimensioni,può essere dna a singolo filamento, come riportato anche qui:

http://www1.qiagen.com/faq/faqview.aspx?faqid=148&SearchText=&FaqCategoryId=0&MenuItemId=0&catalog=1&ProductLineId=1000252

Ciao
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zelos1
Nuovo Arrivato

Occhio!

Prov.: Palermo
Città: Palermo


31 Messaggi

Inserito il - 17 febbraio 2010 : 12:57:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di zelos1  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di zelos1 Invia a zelos1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si, ottima idea, ci avevamo pensato ma non capivamo il motivo, questa è un'ottima conferma grazie!!
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