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dallolio_gm
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 Inserito il - 23 marzo 2010 : 12:37:39
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BioEdit é un programma per visualizzare ed editare allineamenti di sequenze.
clustalw é un programma per allinearle, ovvero un programma che dato un insieme di sequenze ne calcola un allineamento piú o meno ottimale.
Al suo interno, BioEdit ha una funzionalitñá che permette di lanciare clustalw per calcolare l'allineamento.
Per esempio, un ricercatore potrebbe caricare un numero di sequenze nucleotidiche su bioedit, dopodiché lanciare clustalw dall'interno del programma per allinearle in maniera piu' o meno ottimale.
I programmi di allineamento, per limiti tecnici, non forniscono sempre l'allineamento migliore e possono produrre piccoli errori che sono facili da vedere ad occhio nudo, ma difficili da rilevare con un programma. Per questo motivo esistono software come BioEdit, che permettono di visualizzare l'allineamento e correggere errori manualmente. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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bioedit e clustalw?
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