Il fatto che non riesci a trovarla non vuol dire che la sequenza che ti ho mandato sia sbagliata. Il pcDNA3 si usa da quasi venti anni ed č affidabilissimo..forse č probabile che la tua sequenza abbia qualcosa che non va.
prova con un BLAST per alcuni tratti della tua sequenza
basterebbero pochi nucleotidi di differenza per non fartela trovare facilmente, il promotore CMV č noto con tantissime modifiche diverse, verificarle tutte sarebbe improponibile.