Allora, spesso con i microarray normali si fa analisi di espressione genica ossia si analizzano i livelli di espressione di RNA su larga scala...per esempio possiamo comparare un campione di RNA da un individuo sano con un campione di RNA da un individuo per esempio affetto da un tipo particolare di malattia..per vedere se ci sono delle differenze nell'espressione di vari geni..se ne possono così facendo analizzare un numero elevato di geni...
i microarray sui microRNA prevedono lo sesso tipo di analisi ma invece che sugli RNA codificanti proteine lo si fa su questa famiglia particolare di piccoli RNA...che non vengono tradotti in proteine ma una volta processati nel nucleo prima e nel citoplasma poi vanno a determinare la distruzione di molti normnali RNA messaggeri...
per esempio adesso in letteratura è sempre più evidente che in molti tipi di tumori sono modificati i livelli di numerosissimi tipi di microRNA; sia in senso positivo che negativo..