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lux86
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 Inserito il - 13 giugno 2010 : 17:29:41
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ciao a tutti...qual'è la formula per calcolare la T di melting di un primers con un numero di basi maggiore di 18?
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Akujin
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5 Messaggi |
Inserito il - 13 giugno 2010 : 17:55:41
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| La formula più spartana è quella di dale un valore di 4 C° alle G e C, mentre per le A e le T viene dato il valore di 2 C°. Fai la somma di questi numeri basandoti sulla sequenza del tuo primer :) |
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lux86
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 Inserito il - 13 giugno 2010 : 18:03:00
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ecco...la mia prof ha proiettato anche un'altra formula dicendo che qll che hai scritto tu è per primers cn una lunghezza minore di 18 basi, mentre per quelli maggiori dice che è:
64,9+41x[(g+c)-16,4]/n dove n è il numero totale di basi...
ho provato a fare dei calcoli ma non si trova mai il risultato :-( |
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Akujin
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5 Messaggi |
Inserito il - 13 giugno 2010 : 21:22:27
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hai ragione, ho riguardato e per primer maggiori di 18 basi la mia formula tende a dare una stima in eccesso!
Però cercando in rete ho trovato questo esempio ed è corretto :)
Tm = 64.9°C + 41°C x (number of G’s and C’s in the primer – 16.4)/N
Where N is the length of the primer.
For example, Promega’s T7 Promoter Primer (TAATACGACTCACTATAGGG) is a 20mer composed of 5 T’s, 7 A’s, 4 C’s, and 4 G’s. Thus, its melting temperature is calculated:
64.9°C + 41°C x (8 – 16.4)/20 = 47.7°C
Prova a rifare i calcoli con questo esempio! I inizialmente sbagliavo perchè dividevo tutto per n, mentre invece era da dividere soltanto G + C - 16.4 :D |
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lux86
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Inserito il - 14 giugno 2010 : 00:22:38
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| mah...sarò diventata imbecille con la calcolatrice, ma non mi si trova mica il risultato! :-( |
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lux86
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Inserito il - 14 giugno 2010 : 00:24:45
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| fattoooooooooooo....basta scrivere ttt sulla calcolatrice, con aggiunta di parentesi e ***** vari ed è fatta! grazie! |
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Didattica
