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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm
Cittā: Paris, VIIčme arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 23 giugno 2010 : 17:18:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve, devo sostenere un esame di "Struttura delle Proteine" e mi ritrovo inguaiato con Rasmol. Dovrei visualizzare e studiare una proteina multimerica, nel caso la Argininosuccinato sintetasi, con il sovracitato software. Peccato che una volta scaricato il PDB file text dal protein database, rasmol mi mostri soltanto una catena polipeptidica delle quattro, impedendomi perciō di studiare la simmetria e gli assi di simmetria.
La mia domanda é: cosa sbaglio?
Piccolo particolare: se apro, dal link che lo stesso protein database offre, con Jmol, ottengo il tetramero.

Grazie

kORdA
Utente Attivo

newkORdA

Prov.: Milano
Cittā: Monza


1303 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2010 : 12:37:16  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di kORdA  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di kORdA Invia a kORdA un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
qual č il codice PDB del file che hai scaricato?

http://www.linkedin.com/in/dariocorrada
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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Cittā: Paris, VIIčme arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2010 : 21:41:49  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Credo di aver risolto, nel senso che mi son reso conto che in effetti mi indica la sola presenza della catena A, perō non capisco perché quando, online, sul sito di pdb, apro Jmol dal link, posso "giocare" con il tetramero...
La proteina in questione č qui:
http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId=1K97
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0barra1
Utente Senior

Monkey's facepalm

Cittā: Paris, VIIčme arrondissement


3847 Messaggi

Inserito il - 24 giugno 2010 : 21:52:36  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di 0barra1 Invia a 0barra1 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Che stupido che sono! Riporto la soluzione del problema:
dalla pagina web, in alto a destra, alla voce "download files", invece di selezionare PDB file (text),
si clicchi su "biological assembly (gz)".
E ora abbiamo in formato .zip il file sul desktop.

Niubbo che sono , ma almeno ho risolto.


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