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mollichina di pane
Utente Junior
121 Messaggi |
 Inserito il - 19 agosto 2010 : 11:45:57
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Ciao a tutti!
spero di non sbagliare creando una nuova discussione...
Circa a metà luglio avevo chiesto informazioni su un tool che mi permettesse di verificare i siti di splicing in una sequenza.
Mi è stato suggerito BLAT, che mi è stato comunque molto utile.
Girovagando nel web ho trovato un altro tool molto carino che potrebbe fare al caso mio, ma non riesco a capire come fare a farlo funzionare al meglio. Si chiama ASPicDB.
Il mio problema è che ho una sequenza di riferimento di un gene e poi ho la seq del mio gene. Mi sembra che sia avvenuto un exon truncation come splicing, perchè una parte di un esone è scomparsa.
Come faccio a dimostare che è effettivamente un diverso isotipo dovuto a splicing?
Ecco perchè vorrei che qualcuno mi aiutasse a capire come funziona questo programma o se ne conoscete altri utili al mio scopo sarei felicissima di poterli utilizzare!
Grazie!!!
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ASPicDB
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