uno snp è un polimorfismo di singolo nucleotide ovvero dato dalla variabilità tra un ntd ed un altro.Può ricadere in regioni di notevole importanza tipo un sito di restrizione oppure non avere alcun effetto.Identificato uno snp con gli array bisogna poi capire se trattasi di omozigosi o eterozigosi andando ad analizzare l'altro allele.mi fate un esempio di snp in omozigosi e in eterozigosi? Poi per risalire alla condizione di omo o eterozigosità deve effettuare rispettivamente l'ibridazione prima su una copia allelica poi sull'altra?grazie
l'esempio migliore è il caso in cui lo SNP cada in un sito bersaglio di un enzima di restrizione. si fa una PCR sulla regione interessata poi si digerisce con un enzima di restrizione. mettiamo caso che il frammento normale non si digerisca e quello polimorfico si. dopo digestione avremo un frammento più grande per l'allele normale e più piccolo per quello presentante lo SNP. quindi omozigosi normale una sola banda più grande omozigosi con SNP una sola banda più piccola eterozigosi 2 bande delle dimensioni di quelle precendeti questo in estrema sintesi. spero tu abbia capito....