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Autore

Discussione

CRISTIAN
Nuovo Arrivato

92 Messaggi

Inserito il - 12 settembre 2006 : 17:52:52

Ciao qualcuno sa consigliarmi un sito (gratuito)e semplice dove posso disegnare dei primer per una sequenza? e verificare se tra di loro sono compatibili?
Grazie infinite.
Cristian
PS: vi allego il file della sequenza(5'-3'), io cercavo dei primer per amplificare la sequenza che parte dal primo atg e arrivano fino a tctcatccccg.
non riesco a trovare un senso e un antisenso che vanno bene tra loro!!!

Allegato:

SCCA1 NESTED.doc
21,43 KB

GFPina
Moderatore

Citt�: Milano

8408 Messaggi

Inserito il - 12 settembre 2006 : 18:39:08

Io uso un programma:
Primer Premier della Premier Biosoft, puoi scaricare la versione demo che non ti permette di trovare i primers ma comunque puoi analizzarli (per vedere strutture secondarie e cross dimers).
Io ho usato per molto tempo la versione demo prima che me lo comprassero!
il link � questo:
http://www.premierbiosoft.com/primerdesign/index.html

Invece per il disegno dei primer uno dei pi� famosi � PRIMER 3, lo usano in molti, questo � il link:
frodo.wi.mit.edu/cgi-bin/primer3/primer3_www.cgi

P.S. non so perch� non riesco a far funzionare questo link, comunque se lo copi e lo incolli nel browser funziona

chick80
Moderatore

Citt�: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 13 settembre 2006 : 02:56:24

Citazione:
non so perch� non riesco a far funzionare questo link, comunque se lo copi e lo incolli nel browser funziona

Il forum si incasina perch� c'� un www alla fine del link... non ti preoccupare, ho provato a cambiarlo in mille modi ma sembra non esserci soluzione!

Cristian, se ti pu� essere utile in questo topic ho spiegato come generare primer con primer3.

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