Devi disegnare uno dei 2 primers in cui l'ultima base (3') sarā quella dove č presente il polimorfismo, ovviamente ne disegni 2, ognuno specifico per un polimorfismo mentre l'altro primer lo disegni in una regione che sia comune ad entrambi in questo modo farai 2 PCR e otterrai l'amplificato in una o nell'altra a secondo di quale sia il polimorfismo.
Esempio:
TTGTAAGTTCCTTAGATTGTTTA primer F1
TTGTAAGTTCCTTAGATTGTTTT primer F2
GATATTGTAAGTTCCTTAGATTGTTT[A/T]GAACTGAGAGATACTAATTTGCACA----------------------------------
NNNNNNNNNNNNNNNNNNN primer R
Il senso č questo, ovviamente poi devi controllare i primers, io li ho scritti un po' a caso, ma l'importante č che la base al 3' corrisponda a quella dove č presente il polimorfismo.
Disegnare primers per un SNP
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Inserito il - 18 ottobre 2010 : 23:55:06
Inserito il - 19 ottobre 2010 : 10:19:36
