scusate se le mie domande risultano banali ma sono alla prima esperienza in lab e ho bisogno di alcune informazioni. La prima domanda è: quando si usa il gel d'agarosio e quando quello di poliacrilammide in una corsa elettroforetica? seconda domanda: per valutare l'espressione di due geni, ho effettuato una RT-PCR a partire da RNA totale estratto da due ceppi batterici cresciuti in due tipi di terreni,e poi ho caricato i prodotti su un gel di poliacrilammide. qualcuno saprebbe spiegarmi il perchè di tale procedura?AIUTOOO
Sì, essenzialmente, come puoi leggere nei 2 link si tratta solo di una differenza della dimensione delle maglie.
Per la seconda parte della domanda, suppongo che la RT-PCR sia stata fatta con primer per un certo gene che viene modulato da qualche componente del terreno. Quindi sul gel tu vedrai una banda più intensa quanto più quel gene è stato espresso.