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Discussione

clapsy
Nuovo Arrivato

4 Messaggi

Inserito il - 19 gennaio 2011 : 14:51:19

Ciao,

sono nuovo della materia, dopo aver mandato delle bande purificate mi sono tornati gli elettroferogreammi, dopo l'analisi delle sequenze e trasfrormazione picchi in sequenza formato fasta del for e rev devo blastare l'intera sequenza. Ma come si fa? il primer rev devo revertarlo e unirlo alla sequenza for? oppore devo fare il reverse complement, revertarlo ed unirlo alla seq for?

Grazie per l'aiuto

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 19 gennaio 2011 : 18:35:14

Hai un solo forward e un solo reverse?
Devi fare il reverse complement del reverse, allinearlo col forward (se hanno una zona in sui c'� overlap) e blastare il risultato...

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...

clapsy
Nuovo Arrivato

4 Messaggi

Inserito il - 20 gennaio 2011 : 08:12:14

Grazie per la spiegazione. Ho allineato ma devo anche creare una sequenza consenso? Blasto il consenso?

Grazie ancora