Salve a tutti! vorrei chiedervi un aiuto sull'uso di autodock..fino ad ora ho sempre usato questo programma per il docking di piccole molecole organiche, adesso vorrei utilizzarlo per studiare il binding mode della pepstatina nel sito attivo della proteasi di candida albicans (SAP2).La pepstatina è un polipeptide molto più flessibile rispetto alle molecole con cui ho avuto a che fare fino ad ora. Non riesco ad ottenere dei risultati soddisfacenti e penso che il problema sia legato alla maggiore flessibilità del ligando. Qualcuno sa darmi delle dritte?