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fpotpot
Utente
Città: middleofnowhere
1056 Messaggi |
 Inserito il - 13 ottobre 2006 : 12:21:09
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ciao a tutti!
ipotizzate di avere una proteina della saliva,con cui lavorate.
la domanda e':puo'esserci una differenza funzionale tra una proteina sintetizzata chimicamente come sequenza di aa,la proteina quando e' purificata con cromatografia dalla saliva e la proteina quando viene prodotta da un e.coli o un lievito dove e' stato clonato il gene che la codifica?
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Gabriele
Utente
Prov.: Pisa
Città: Pisa
615 Messaggi |
Inserito il - 13 ottobre 2006 : 13:32:45
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La proteina sintetizzata potrebbe mancare di modificazioni post-trasduzionali essenziali per il suo corretto funzionamento.
Acetilazioni,metilazioni,glicosilazioni etc. |
"Chi rinuncia alla libertà per la sicurezza, non merita né la libertà né la sicurezza. E finirà col perdere entrambe." |
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fpotpot
Utente
Città: middleofnowhere
1056 Messaggi |
Inserito il - 13 ottobre 2006 : 13:46:56
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| mmm...e come faccio a vedere questo?la sequenza e' la stessa... |
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AleXo
Moderatore
Prov.: Estero
Città: San Francisco, California
1550 Messaggi |
Inserito il - 13 ottobre 2006 : 15:15:16
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nice question!
sono di fretta ma ad esempio la glicosilazione altererà parekkio il peso molecolare apparente in sds-page. Così come un eventuale processo di maturazione proteolitico...
ma nulla è noto su questa proteina? |
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fpotpot
Utente
Città: middleofnowhere
1056 Messaggi |
Inserito il - 13 ottobre 2006 : 15:29:45
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e' nota la sequenza completa,son solo 43 aa,si sa che la parte N terminale (1-21 aa)ha due serine fosforilate in 2nda e 3a posizione e sembra avere confromazione di alfaelica.La funzione di questa parte sembra essere di essere assorbita al minerale dello smalto dei denti Ma la parte C-terminale (in teoria random coil)nn si assorbe al minerale e sembrerebbe avere degli epitopi riconosciuti da qualche specie di batteri.
Non ci sono cisteine e quinsi non S-S ponti che facciano pensare a condizioni redox che influenzino attivita'.
detto questo...
help!! |
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dallolio_gm
Moderatore
Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna
2445 Messaggi |
Inserito il - 13 ottobre 2006 : 16:35:57
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Citazione:
Messaggio inserito da fpotpot
ciao a tutti!
ipotizzate di avere una proteina della saliva,con cui lavorate.
la domanda e':puo'esserci una differenza funzionale tra una proteina sintetizzata chimicamente come sequenza di aa,la proteina quando e' purificata con cromatografia dalla saliva e la proteina quando viene prodotta da un e.coli o un lievito dove e' stato clonato il gene che la codifica?
Mi vengono in mente le forme di splicing.
Ricorda che esiste anche lo splicing a livello della sequenza aminoacidica (dopo quello dell'RNA), e che anche i prodotti che apparentemente non hanno significato possono essere importanti. |
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-) |
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 20 ottobre 2006 : 05:35:32
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Coli fa solo acetilazione, non glicosilazione.
Il lievito può anche glicosilare ma magari non nello stesso modo delle cellule eucariotiche superiori.
Puoi notare le differenze su SDS-page o cromatografia, inoltre se cerchi delle sequenze di glicosilazione sulla proteina puoi poi trattare con glicosilasi specifiche e vedere se la proteina corre diversamente su sds-page prima e dopo il trattamento. |
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fpotpot
Utente
Città: middleofnowhere
1056 Messaggi |
Inserito il - 20 ottobre 2006 : 11:11:29
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mmmmm....mumble mumble....grazie mille!!! |
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Discussione |
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come vien prodotta proteina influenza funzione?
Didattica
