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elisacarli
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83 Messaggi

Inserito il - 28 marzo 2011 : 14:15:01  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di elisacarli Invia a elisacarli un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti

Sto cercando un tutorial/libro o documento che tratti l'utilizzo avanzato per una modellazione manuale con Deep Viewer/swiss pdb viewer.
Ad. es. come ci si comporta se si trovano gap? Se il modello in fase di validazione riporta errori, come facciamo a risolvere?
Come č possibile integrare le informazioni ottenute da predizioni di struttura secondaria, di disordine etc.. con la modellazione manuale?

ringrazio in anticipo

domi84
Moderatore

Smile3D

Cittā: Glasgow


1724 Messaggi

Inserito il - 28 marzo 2011 : 19:57:10  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di domi84 Invia a domi84 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Di solito il manuale ti offre molte informazioni, hai provato a darci un occhio?
Per quanto riguarda i gap, ad esempio:
http://spdbv.vital-it.ch/modeling_tut.html

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...
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elisacarli
Nuovo Arrivato



83 Messaggi

Inserito il - 29 marzo 2011 : 07:13:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di elisacarli Invia a elisacarli un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao,

Ho guradato il manuale, ma non ho trovato i chiarimenti che cercavo.
Ad es. se ho un gap possono distinguersi due casi diversi:
1) gap su seq. da modellare
2) gap su seq. del template.

Come faccio a risolvere?

grazie e saluti
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