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Autore

Discussione

reverie
Nuovo Arrivato

2 Messaggi

Inserito il - 19 aprile 2011 : 17:37:24

salve a tutti!!
dovrei svolgere il seguente esercizio di bioinformatica, tuttavia mi riesce complicato.
Mi aiutate??
grazie!!

Partendo dall�ID ufficiale HGNC del vostro gene(NDRG4) (umano) di partenza:

1) Localizzate il vostro gene sul genoma (per l�uomo, utilizzate sempre la versione 2006 del genoma). Quanti trascritti RefSeq sono annotati per il gene? Quanti trascritti UCSC genes? Quanti altri RNA possono essere considerati trascritti alternativi del gene (indicarne alcuni)? Sono tutti mRNA codificanti? indicarne alcuni
2) Il gene ha almeno due trascritti alternativi che modificano la sequenza della proteina codificata?
3) Disegnate una coppia di primer che permettano di discriminare i due trascritti del punto precedente tramite PCR (ovvero, di amplificare una regione che ha solo uno dei due trascritti)
4) In quali tessuti � principalmente espresso il gene?
5) In quali �pathway� � coinvolto il gene?
6) Quali annotazioni Gene Ontology riuscite a trovare per il gene?
7) Nella regione compresa tra un milione di paia di basi a monte e un milione di paia di basi a valle del gene, quanti altri trascritti RefSeq sono annotati?

Sofia

domi84
Moderatore

Citt�: Glasgow

1724 Messaggi

Inserito il - 19 aprile 2011 : 20:35:36

Ciao reverie e benvenuto/a sul forum!
Prova a fare l'esercizio secondo le tue conoscenze, e se trovi qualche difficolt� specifica noi ti possiamo aiutare!!!

Il mio blog: http://domi84.blogspot.com/
Le foto che ho scattato...