quantificazione relativa RT PCR

Forum

Registrati Discussioni Recenti Preferiti Utenti Cerca Regolamento RSS Statistiche

Utilità

I libri
consigliati:

Biologia della cellula e molecolare
Eduardo D. P. De Robertis, Eduardo M. F. De Robert

Virologia
Renato Dulbecco, Harold S. Ginsberg

Biotecnologie della vita quotidiana
Adriana Bazzi, Paolo Vezzoni

Altri Libri

Nome Utente:	Password:
Riconoscimi automaticamente

Tutti i Forum

MolecularLab

Tecniche

quantificazione relativa RT PCR

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Risorse di Tecniche di Laboratorio:

Didattica e Relazioni

InsideBlog

Siti Scientifici

Protocolli Laboratorio

Siti Scientifici

Ultime notizie

Aggiungi i tag

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Autore

Discussione

Federicax1989
Utente Junior

316 Messaggi

Inserito il - 02 giugno 2011 : 18:41:09

Ciao a tutti, non ho capito la quantificazione relativa e non capisco la differenza tra queste due tabelle

	

           Disch.   | actina |  �Ct (B2-C2) ��Ct |(D�-cal)2^-��Ct (2^-E)

Normale	30	27	3         0	            1
Tumore	32	28	4         1	            0.5
					
Cal					
3



	Discherina actina �Ct (B2-C2)	��Ct (D�-Cal)	2^-��Ct(2^-E)

Wt         30	   28	   2	            0	           1
1h         28	   28	   0	            -2	           4
2h         26	   28	  -2	            -4	           16
4h         25	   28	  -3	            -5	           32
8h         25	   27	  -2	            -4	           16
					
cal					
2

thejoint84
Nuovo Arrivato

46 Messaggi

Inserito il - 02 giugno 2011 : 18:50:29

nella seconda tabella dopo il trattamento l�actina resta uguale (buon segno).....significa che l�azione di quello che usi � specifica.... la discherina, act e aacr diminuiscono e l�ultimo gene in tabella � stimolato.....

La prima tabella sembra incomprensibile....almeno solo con questi dati io non ci capisco molto...

http://cornermolecularbiology.blogspot.com/

Federicax1989
Utente Junior

316 Messaggi

Inserito il - 02 giugno 2011 : 18:59:46

Citazione:
Messaggio inserito da thejoint84

nella seconda tabella dopo il trattamento l�actina resta uguale (buon segno).....significa che l�azione di quello che usi � specifica.... la discherina, act e aacr diminuiscono e l�ultimo gene in tabella � stimolato.....

La prima tabella sembra incomprensibile....almeno solo con questi dati io non ci capisco molto...

no non voglio un commento di questo tipo..mi servirebbe una spiegazione generale

thejoint84
Nuovo Arrivato

46 Messaggi

Inserito il - 02 giugno 2011 : 22:45:36

quando fai esperimenti come pcr, western blot, northern,ecc. quello che fai � vedere cosa succede alle tue proteine, RNA o DNA. Quando fai questo di solito lo fai in seguito a trattamenti con ignu sirta di composti chimici o biologici.
Alla fine del tuo esperimento hai i risultati.... per esempio nel tuo secondo grafico discherina diminuisce.... Per poter dire che discherina diminuisce e che RNA X no, di solito si analizzano messaggeri, nella RT-pcr chiamati housekeeping, che non cambiano in seguito ai trattamenti....
Un housekeepig molto usato � l'actina....
Nel tuo secondo caso vedi che l'actina non subisce variazioni, se non a 8 ore.... la quantificazione relativa � la quantificazione dei tuoi prodotti di pcr rispetto alla tua actina....

wt 30 28
1h 28 28
2h 26 28
4h 25 28
8h 25 27

nei wt,1,2 e 4 ore non devi quantificare niente perch� l'actina � uguale.... nell'ultimo campione, a 8 ore l'actina diminuisce. 27 su 28 � esattamente il 96%. nella quantificazione relativa tu prendi il valore di discherina a 8 ore, e al suo posto ci metti il 96%, per renderlo paragonabile all'acrina e "eliminare" o minimizzare l'effetto aspecifico della sostanza, quello che c'� sull'actina e su tutti o quasi i tuoi mRNA. Quindi al posto di 25 devi mettere 24... che � il 96%.
Spero di essermi spiegato bene......

http://cornermolecularbiology.blogspot.com/

Discussione

Quanto � utile/interessante questa discussione:

Nuova Discussione

Nuovo Sondaggio

Rispondi

Aggiungi ai Preferiti

Cerca nelle discussioni

Vai a:

MolecularLab.it

Android e Mobile



Scarica le app! Ora anche sul tuo smartphone!

Ciao Login - Iscriviti



Visitatori: 351

Novità
Protocolli di laboratorio: reagenti e tecniche usate in laboratorio biomedico e molecolare.