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f.a.
Nuovo Arrivato
Città: udine
23 Messaggi |
 Inserito il - 28 giugno 2011 : 16:33:37
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Ciao a tutti, ho un dubbio sui geni HOX e in particolare sulla sequenza omebox: allora, so che i geni HOX sono espressi in varie combinazioni lungo l'asse antero-posteriore dell'embrione e assegnano ad ogni segmento la propria identità. Quindi se non ho capito male c'è un gene HOX per ogni segmento.
La mia domanda è: la sequenza omebox è la stessa sia per i geni HOX del torace che per quelli dell'addome ecc? o è ugale solo tra i geni HOX specifici per un segmento?...cioè c'è una sequenza diversa per ogno specifico segmento o c'è solo un tipo di sequenza omebox in tutto il DNA?
Grazie mille!
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 28 giugno 2011 : 19:03:45
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| Per quanto ne so ogni gene HOX codifica per un prodotto proteico di regolazione dell'espressione genica. Ogni gene HOX inoltre che ha la cosiddetta "omeobox", cioè una sequenza conservata evolutivamente di 180 nucleotidi circa che codifica per un dominio di interazione col DNA del tipo helix-turn-helix. Ora il dominio, in quanto tale, è conservato in tutti e geni HOX (che rappresentano una famiglia proprio per questo), ma la sequenza in basi, e quindi in AA, varia da gene a gene; tant'è che se fai una proteina chimerica fondendo un intera proteina codificata da un gene HOX (proteina1), escludendo però il suo omeodominio, e lo sostituisci con l'omeodominio di un'altra proteina (proteina2), codificata da un altro gene, quest'ibrido andrà a legarsi alle stesse regioni del DNA a cui si lega di solito la proteina2! |
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f.a.
Nuovo Arrivato
Città: udine
23 Messaggi |
Inserito il - 29 giugno 2011 : 12:11:17
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Ciao Geeko! Grazie per la risposta! Mi è rimasto un dubbio però:
non capisco ancora in cosa esattamente siano simili i domini codificati dalle omebox... quando dici "il dominio in quanto tale" non capisco a cosa ti riferisci..se sono diversi in basi in cos'altro possono essere confrontati i vari domini? considerando che la struttura HTH è comune anche in altri regolatori (es.repressore lac)..
Grazie mille! |
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Geeko
Utente
Città: Milano
1043 Messaggi |
Inserito il - 29 giugno 2011 : 13:49:10
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Sinceramente non so risponderti con certezza; vero che domini HTH non sono esclusivi dei prodotti dei geni HOX, ma intanto tutte queste proteine hanno quel tipo di struttura base di interazione col DNA, inoltre saranno sicuramente stati fatti studi di omologia tra sequenze aminoacidiche per queste proteine, tanto da farle raggruppare tutte in una famiglia. In particolare si crede, anche confrontando esempi di organismi filogeneticamente più o meno distanti, che questa famiglia genica si sia originata per eventi di duplicazione in serie di un gene ancestor, con successiva divergenza fino ad assumere la disposizione dei quattro cluster per come la conosciamo adesso (nei mammiferi). Poi ovviamente hanno in comune anche il loro funzionamento generale, in base alla funzione che svolgono, di solito sempre correlata alla specificazione dei segmenti corporei.
Ma mi rendo conto di non aver risposto veramente al tuo dubbio. |
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f.a.
Nuovo Arrivato
Città: udine
23 Messaggi |
Inserito il - 29 giugno 2011 : 15:07:20
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Non importa, grazie di averci provato! e poi mi hai detto cose comunque molto interessanti! Quindi grazie! ciao
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geni HOX - sequenza omebox
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