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CIOCCOELI
Nuovo Arrivato

Prov.: Pisa
Città: PISA


9 Messaggi
Inserito il - 14 novembre 2006 : 18:39:57  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di CIOCCOELI Invia a CIOCCOELI un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Salve a tutti, un chiarimento per le ESTs.
Potete dirmi per benino che sono di preciso (sn cloni di cDNA??), come si ottengono, cioè da cosa partiamo e quali sono gli steps.
Sono utili per studiare la trascrittomica su larga scala..perchè???

Grazie a tutti!
ELISA DI BUGNO

chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 14 novembre 2006 : 19:46:21  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sono le expressed sequence tags.

Vedi http://www.molecularlab.it/forum/topic.asp?TOPIC_ID=1625
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CIOCCOELI
Nuovo Arrivato

Prov.: Pisa
Città: PISA


9 Messaggi
Inserito il - 14 novembre 2006 : 20:36:15  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di CIOCCOELI Invia a CIOCCOELI un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si ok sn tutti discorsi interessanti..ma di fatto sono cloni di cDNA?Cioè come si ottengono..da un campione, estarggo mRNA, retrotrascrizione a CDNA e poi..com'è che possono essere a lunghezzacompleta e incompleta..così sta scritto in rete??
grazie d nuovo
ELISA DI BUGNO
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chick80
Moderatore

DNA

Città: Edinburgh


11491 Messaggi
Inserito il - 15 novembre 2006 : 10:36:27  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di chick80 Invia a chick80 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Si ottengono sequenziando le estemità di cloni da librerie di cDNA.

Lunghezza completa e incompleta dipende semplicemente dal fatto che per problemi tecnici non si riesce a volte a sequenziare completamente tutto il cDNA.

Qui trovi una bella spiegazione
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=handbook.section.858
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CIOCCOELI
Nuovo Arrivato

Prov.: Pisa
Città: PISA


9 Messaggi
Inserito il - 15 novembre 2006 : 11:07:03  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di CIOCCOELI Invia a CIOCCOELI un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Scusa, nn sapevo cross-posting..
riguardo a est..le estremità??
cioè partendo da mRNA, arrivi a cDNA, ottieni i cDNA e parti sequenziando le estremità..3' o 5'..e perchè? sn quelle che identificano univoacmente qualcosa..??ma perchè?
grazie di nuovo
ELISA DI BUGNO
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