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 Gene targeting in cellule umane con IDLV o baculovirus
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sofia1988
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5 Messaggi

Inserito il - 22 marzo 2012 : 15:13:32  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di sofia1988 Invia a sofia1988 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
So che vettori di lentivirus integrasi diffettivi (IDLV) diminuisco di molto gli eventi di integrazione casuale nel genoma ospite, tuttavia è noto che non eliminano del tutto il rischio di tali eventi indesiderati. In un articolo che ho letto è stato dimostrato che questi eventi rari di integrazione possono essere dovuti a ricombinazione casuale di fondo e non tanto a retromutazione del gene mutato per l'integrasi. Un altro articolo proponeva un lavoro di gene targenting usando baculovirus invece di IDLV per evitare il problema dell'integrazione dei retrovirus. Il mio dubbio è: se l'integrazione di IDLV è dovuto a eventi causali di ricombinazione di fondo non mediato dall'integrasi, allora anche il vettore baculovirus può subire questi eventi di ricombinazione casuale; allora perchè un sistema basato su vettori di baculovirus dovrebbe essere più sicuro di quello IDLV?

Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 22 marzo 2012 : 15:38:14  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Infatti non mi pare sia affatto dimostrato che l'integrazione casuale degli IDLV possa
comportare dei "rischi" dal punto di vista mutagenico o genotossico. Hai trovato referenze a riguardo?

Gli IDLV si inseriscono causalmente allo stesso modo in cui puo' farlo un plasmide o un episoma,
con la differenza che alcuni genomi virali episomali sono naturalmente destinati a rimanere in
una forma extracromosomica (e.g. gli adenovirus), magari perchè cromatinizzano in un certo modo.
Gli LTR-circles formati dai lentivirus sono naturalmente destinati a integrarsi, ma negli IDLV
non possono farlo in maniera catalizzata (e quindi guidata) perchè il sito attivo dell'integrasi
è mutato. Non possiamo escludere che abbiano comunque una intrinseca propensione a dirigersi
verso i cromosomi, visto il loro "natural destino". Tuttavia non ricordo sia mai stato dimostrato.

Volere libera : questa é la vera dottrina della volontà e della libertà
(F.W. Nietzsche)

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batsake89
Nuovo Arrivato

Prov.: bari
Città: andria


12 Messaggi

Inserito il - 14 agosto 2012 : 01:56:45  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di batsake89 Invia a batsake89 un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Perdonate la domanda banale: ma i fenomeni di ricombinazione casuale a cosa sono dovuti? A DSB (double strand breaks) che vengono riparati per ricombinazione omologa tra il DNA genomico e il vettore?
Questo dubbio mi ricollega ad un'altra domanda: nel gene targeting, cosa rende possibile la ricombinazione omologa tra il vettore e il DNA genomico? Si deve attendere un evento di ricombinazione casuale? o c'è un modo per far avvenire la ricombinazione senza dover aspettare eventi casuali?
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Dionysos
Moderatore

D

Città: Heidelberg


1913 Messaggi

Inserito il - 15 agosto 2012 : 17:26:12  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Dionysos  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di Dionysos Invia a Dionysos un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Citazione:
o c'è un modo per far avvenire la ricombinazione senza dover aspettare eventi casuali?


Electroporation

or

http://en.wikipedia.org/wiki/Zinc_finger_nucleases


:)

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