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 AliBaBa e la ricerca di interazioni tra proteine
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 12:01:52  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
hola,
che ne pensate di questo tool: http://alibaba.informatik.hu-berlin.de/ ?
Lo sto provando ora e non mi sembra male. E' un programma scritto in Java che analizza automaticamente la letteratura da pubmed e la organizza in un grafo, in modo da visualizzare una rete di interazioni di una proteina creata grazie al data-mining.

Peccato che mi sembri più portato allo studio di proteine, altrimenti mi sarebbe stato più utile... però magari a qualcuno di voi può interessare. como os parece?

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)

MariBi
Utente Junior



170 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 13:44:39  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di MariBi Invia a MariBi un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ma graziee!!! Indovina nella riunione di stamattina io e il mio gruppo che problema ci siamo posti? le reti d'interazione delle proteine e le organizzazioni in grafo!!! Che combinazione! Inizio a studiarlo da subito! Thanks a lot!
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Città: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 14:03:47  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
ottimo!
Forse ti può essere utile anche il database string (http://string.embl.de), che dovrebbe fornirti risultati più curati, e se la tua proteina é di uomo, ratto o topo puoi usare anche http://harvester.embl.de .

Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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MariBi
Utente Junior



170 Messaggi

Inserito il - 19 dicembre 2006 : 14:23:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di MariBi Invia a MariBi un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mi metto subito a studiarli! Grazie ancora...che bello avere una rete di amici....!
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