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 Gene Screen / ricerca snp e mutazioni in mezzo a molte seqs
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ChemicalHappiness
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tempusfugit


2 Messaggi

Inserito il - 03 maggio 2012 : 11:48:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di ChemicalHappiness Invia a ChemicalHappiness un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti! e buona primavera!!

poichè sto navigando tra grandi quantità di pazienti dei quali devo screenare un intero, se pur piccolo, gene; mi sarebbero molto utili programmi bioinformatici per leggere tante sequenze contemporaneamente ed individuare automaticamente snp, mutazioni eventuali and so on... invece che leggere 2000ntds per 2000 pazienti.
ho trovato in freeware, dall'università di leeds, questo GeneScreen (http://dna.leeds.ac.uk/genescreen/).
sembra semplice e potente ma forse mi son perso qualcosa nelle spiegazioni, non riesco a capirlo perfettamente. fallisce le analisi, mi allinea le cose un po' a caso. mette gli aminoacidi con i nucleotidi ed altri piccoli disguidi...
di qui la domanda tanto attesa:
qualcuno lo usa?
sa spiegarmi o ha qualcosa di più concreto della guida walktrought online?
o, addirittura, usa qualche programma similare e/o migliore da consigliarmi?

se vi vengono idee bislacche, balzane o azzardate provate pure
in ogni modo grazie per l'attenzione!!

_have a nice day_

Diego
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