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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi
Inserito il - 25 dicembre 2006 : 16:36:46  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ki č ke mi da il link x usare l'algoritmo di predizione MirGene? Io nn lo trovo!
Farah

dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 27 dicembre 2006 : 11:09:43  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Sei sicura che sia mirgene e non Mirscan (http://genes.mit.edu/mirscan/)?
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi
Inserito il - 27 dicembre 2006 : 19:35:38  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
A questo punto mi fai sorgere dei seri dubbi..so ke questo algoritmo dovrebbe fare una ricerca incrociata tra i vari programmi di predizione, tipo Miranda ed affini..ma nn l'ho mai visto all'opera. Ma se fosse Mirscan..come andrebbe usato?
Farah
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dallolio_gm
Moderatore


Prov.: Bo!
Cittā: Barcelona/Bologna


2445 Messaggi
Inserito il - 30 dicembre 2006 : 00:39:30  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di dallolio_gm  Clicca per vedere l'indirizzo MSN di dallolio_gm Invia a dallolio_gm un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
uhm ma Miranda non č un programma per la predizione di geni, ma per l'identificazione di target di miRNA: http://www.microrna.org/miranda_new.html

Per la predizione di geni ti consiglio di usare qualche genome browser (UCSC, ensembl), perchč integrano delle analisi di predizione ben fatte e permettono di confrontare i risultati giā calcolati di diversi programmi.
Il mio blog di bioinformatics (inglese): BioinfoBlog
Sono un po' lento a rispondere, posso tardare anche qualche giorno... ma abbiate fede! :-)
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Marianna
Utente Junior




146 Messaggi
Inserito il - 30 dicembre 2006 : 20:43:20  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di Marianna Invia a Marianna un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Rileggendo il tutto mi rendo conto ke mi sono spiegata veramente male...io devo fare proprio quello ke fa miranda ma con questo programma, ke a questo punto nn so + come si kiama, ke riesce ad integrare i risultati ottenuti da vari programmi...uff..ke fatica solo a parlarne...!

Grazie.

PS:AUGURI DI BUON ANNO A TUTTO IL FORUM !!!
Farah
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