L'Azoto atmosferico per essere utilizzato deve essere fissato. La Fissazione può essere abiotica attraverso l'energia delle scariche elettriche dei fulmini, infatti in presenza di ossigeno si formano ossidi di azoto, o biologica. la fissazione biologica è catalizzata dalla nitrogenasi presente in alcuni microrganismi azotofissatori la reazione è 8 H ++ N2 #8594; 2NH3 + H2. L'azoto fissato è convertito in gruppo amminico e passa nella catena alimentare, alla morte dei microrganismi è liberato come NH3 ma reagisce con H+ e dà NH4+. L' NH4+ tramite Nitrificazione è trasformato in NO3 utilizzabile dalle piante. La reazione avviene in due tappe grazie a batteri chemioautotrofi aerobi obbligati : NH4+#8594; NO2 (batteri ammonio ossidanti o nitrosanti es nitrosomonas) poi NO2#8594; NO3 ( bat nitrificanti es Nitrobacter). NO3 è utilizzato dalle piante, avviene la riduzione assimilativa, passa nella catena alimentare. L'azoto è liberato come ammoniaca nei prodotti di rifiuto (ammonificazione). NO3 non assimilato in condizioni anaerobiche è soggetto a Denitrificazione che porta alla liberazione di N molecolare e N2O.
Questo molto in sintesi se ci sono cose che non sono chiare chiedi.