Microarray: qual è la sonda e quale il bersaglio?

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Geeko
Utente

Città: Milano

1043 Messaggi

Inserito il - 26 luglio 2012 : 21:29:38

Domanda a bruciapelo, perché trovo cose discordanti...

Quando si parla di microarray, cosa si identifica col termine "sonda/e"? I frammenti di DNA immobilizzati sul vetrino o il pool di cDNA che si deposita sullo stesso?

Non è una domanda concettuale..più che altro per capire come si usa la terminologia...traslando il concetto di sonda da tecniche come il northern-blot ai microarray io darei il nome "sonda" all'insieme di tutti gli oligonucleotidi/cDNA fissati sul chip/vetrino, ma essendo immobili questo mi storpia un po' l'immagine della sonda che se ne va per i fatti suoi per fornirci dei dati

chick80
Moderatore

Città: Edinburgh

11491 Messaggi

Inserito il - 27 luglio 2012 : 07:55:29

Le sonde sono decisamente quelle sul chip, quello che ci metti tu è il campione.

In teoria nulla ti vieta di fissare il DNA che vuoi analizzare su di un chip e metterci sopra le sonde (ovviamente sarebbe estremamente laborioso e costoso)

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Geeko
Utente

Città: Milano

1043 Messaggi

Inserito il - 27 luglio 2012 : 09:06:28

Perfetto, dubbio risolto