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marco cenni
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
 Inserito il - 27 agosto 2004 : 06:45:10
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Sto cercando dispense e/o appunti di Bionformatica e Biologia Molecolare, in Italiano , in digitale.
Dove potrei trovarli?
Grazie
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 27 agosto 2004 : 09:26:16
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A settembre su questo sito verrà inaugurata la nuova sezione didattica con tantissimo materiale... se puoi attendere qualche giorno ancora qui troverai tutto!
nICO |
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marco cenni
Nuovo Arrivato
4 Messaggi |
Inserito il - 28 agosto 2004 : 07:27:47
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Posso aspettare.
Sotto l'elenco degli argomenti che mi interesano.
Ti sarei grato se tu potessi consigliarmi anche un buon libro di testo in Italiano, che li tratti
Introduzione alle tecniche di progetto e analisi degli algoritmi
Programmazione dinamica per l'allineamento di due sequenze
Markov chain e Hidden Markov model
Hidden Markov model per l'allineamento di due sequenze
Programmazione dinamica per allineamenti multipli
Hidden Markov model per allineamenti multipli
Transformational grammars
Reti neurali: Applicazioni biologiche
Introduzione alle reti neurali
Fondamenti neurobiologici
Perceptron e reti multistrato
Reti ricorsive per sequenze e strutture dati
Modelli per l'apprendimento automatico
Algoritmi di apprendimento con supervisione per pattern statici e dinamici
Backpropagation ed algoritmi derivati
Mappe di Kohonen
Applicazioni a problemi di folding di proteine.
Generalità sulla struttura delle proteine
Le forze che determinano la stabilizzazione delle strutture macromolecolari
Le tecniche sperimentali per la determinazione strutturale di biomolecole
Predizioni di struttura secondaria e terziaria delle proteine
Visualizzazione di strutture proteiche
Modellazione di strutture mediante uso di server remoti
Ingegnerizzazione di mutanti
Omologia, analogia, omoplasia
Alberi filogenetici e loro proprietà
Scuole filogenetiche
La cladistica: principi di costruzione degli alberi filogenetici
Taxa monofiletici, parafiletici e polifiletici
Il principio della Massima Parsimonia
Mappatura dei caratteri e lunghezza dei rami
Tipi di dati: differenze tra dati morfologici e molecolari
Tipi di dati molecolari
Metodi di ricostruzione filogenetica
Differenze tra metodi basati sulle distanze e metodi basati su caratteri discreti
Differenze tra metodi algoritmici e metodi basati su un criterio di ottimizzazione
Il principio del Minimum Evolution
Il principio della Maximum Likelihood
Lakelihood-ratio tests
Test di significatività degli alberi
Metodi di stima dell’affidabilità dei nodi: bootsrap, Beremer
Significato biologico degli alberi: species vs. gene tree
Genomica
Introduzione: la scienza degli -omi
La Genomica
Metodi sperimentali per la determinazione della sequenza nucleotidica.
Strategie di sequenziamento globale e metodi per la ricostruzione della mappa fisica di genomi procariotici ed eucariotici.
Organizzazione dei dati di sequenziamento: basi di dati e software di visualizzazione
Come nasce una proteina "in silico": predizione delle regioni codificanti e annotazione funzionale
La genomica comparativa e l’analisi statistica dei genomi. Geni ortologhi e geni paraloghi.
La Genomica Strutturale: descrizione di un progetto.
Trascrittomica e Proteomica
La Trascrittomica nell’era post-genomica:
Metodi sperimentali per la produzione di cDNA. Sequenze EST e cDNA a tutta lunghezza.
Organizzazione dei dati trascrittomici e loro mappatura sui genomi.
Analisi comparativa dell’espressione genica basata su mRNA: il "differential display"
Analisi dell’espressione genica basata su dati SAGE
L’uso dell’ibridazione su "microarrays" e le strategie di analisi statistica dei dati
La Proteomica nell’era post-genomica
Metodi sperimentali per la separazione elettroforetica di miscele proteiche complesse: l’elettroforesi bidimensionale computerizzata ad alta risoluzione e HPLC multidimensionale.
Digitalizzazione delle immagini elettroforetiche. Software dedicati di analisi d’immagine per la valutazione comparativa delle differenze qualitative e quantitative in gel elettroforetici diversi
La spettrometria di massa applicata al proteoma: strumenti informatici per l'identificazione proteica via "peptide mass fingerprinting" e sequenziamento proteico (MS/MS).
Analisi delle modificazioni co- e post-traduzionali delle proteine
Analisi dei sub-proteomi: "arrays" di proteine e SELDI-TOF.
Reti geniche e strumenti informatici-matematici per la ricostruzione di moduli funzionali:
Algoritmi di clustering
Modellizzazione delle reti
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chick80
Moderatore
Città: Edinburgh
11491 Messaggi |
Inserito il - 28 agosto 2004 : 11:03:58
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Per argomenti così specifici di bioinformatica dubito si trovino testi in italiano... magari Ricky o qualcun altro + bioinformatico di me ne sa qualcosa! (purtroppo non ho fatto corsi così specifici, quindi non so aiutarti).
Sicuramente in giro su Internet trovi un bel po' di roba in inglese, ma ovviamente un libro sarebbe meglio strutturato.
nICO |
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atreliu
Amministratore
Prov.: Milano
Città: Milano
2484 Messaggi |
Inserito il - 01 settembre 2004 : 00:58:15
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Ed eccomi soccorrere in aiuto..
O meglio... per la sezione Reti Neurali non ci sono testi in italiano, ho degli appunti che potrei e vorrei mettere online, percui prometto che relativamente presto metterò nella sezione Bioinformatica anche le mie conoscenze sulle Reti Neurali (dove ho preso 30 e Lode!!).
Riguardo alla bioinformatica, incominciano ad esserci dei discrti libri, uno è della Zanichelli, Bioinformatica, tra gli autori Pesole, le esercitazioni sono presenti anche in questo sito, nella sezione Didattica > Bioinformatica.
Per il resto, come già preannunciava chick, fra qualche settimana la sezione didattica dovrebbe essere ben rimpinguata, con moolto materiale, che dovrebbe coprire abbastanza delle tue richieste.
Mi segno questa discussione, con l'opzione "Segnalibro", così da vedere se avremo coperto le tue richieste fra una settimana o due..
Spero che il sito ti offra nel frattempo del materiale che ti possa interessare.
Riky |
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Riddle
Nuovo Arrivato
22 Messaggi |
Inserito il - 01 settembre 2004 : 18:42:11
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http://bioinformatics.cribi.unipd.it/testo/ questo è il sito del libro che ti suggeriva atreliu, puoi trovarci il sommario del libro, cosi gli puoi dare un occhiata e vedere se ti interessa o meno.
ciao.
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