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DanyD
Nuovo Arrivato



35 Messaggi
Inserito il - 14 febbraio 2013 : 16:09:19  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di DanyD Invia a DanyD un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Ciao a tutti, cosa si intende per marcatore molecolare riproducibile?
Grazie!

DanyD
Nuovo Arrivato



35 Messaggi
Inserito il - 16 febbraio 2013 : 14:18:44  Mostra Profilo  Visita l'Homepage di DanyD Invia a DanyD un Messaggio Privato  Rispondi Quotando
Mi rispondo da solo nel caso in cui qualcuno passi di qua in futuro e abbia bisogno di questa informazione.
Un esempio di scarsa riproducibilità di un marcatore è la tecnica RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), amplificazione casuale di DNA polimorfico.
Questa tecnica si basa sull'utilizzo di primer aspecifici (di circa 10 bp e che fungono sia da forward che da reverse) per amplificare tramite PCR sequenze distribuite in tutto il genoma di un individuo.
I profili così ottenuti sono confrontati con quelli di individui della stessa o di differenti popolazioni per ottenerne informazioni.
E' considerata una tecnica poco riproducibile in quanto al variare delle condizioni della PCR (per esempio tempi più lunghi per ogni ciclo) o della concentrazione iniziale dei reagenti, variano anche i profili RAPD.
Allora per due individui possiamo avere profili RAPD totalmente differenti anche se fatti dopo pochi minuti uno dall'altro, per i motivi suddetti.
Nel 1998 Jones [c]et al.[/c] eseguirono diverse RAPDs, con condizioni sperimentali rigidamente uguali in nove laboratori diversi sparsi in Europa, ottenendo però pattern non sempre uguali tra loro. Essi spiegano che non è facile ottenere la riproducibilità se viene cambiato il materiale di consumo o il personale.
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